Walker motifs
http://dbpedia.org/resource/Walker_motifs an entity of type: Thing
Les motifs de Walker sont des séquences d'acides aminés observés dans de nombreuses protéines et qui présentent une structure tridimensionnelle hautement conservée. Ces structures ont été décrites pour la première fois par Walker et al. en 1982.
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Walkerモチーフ(英: Walker motifs)は、高度に保存された三次構造を持つタンパク質配列モチーフであり、Walker AとWalker Bの2つのモチーフからなる。これらのモチーフは1982年にジョン・E・ウォーカーらによって、ATP結合タンパク質の比較から初めて報告された。
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Un bucle P o bucle de unión a fosfato es un motivo de unión a ATP o GTP que se encuentra en muchas proteínas de unión de nucleótidos. Se trata de un bucle rico en glicina precedido de una lámina beta y seguido por una hélice alfa. Interactúa con los grupos fosfato de los nucleótidos y el ion Mg2+, que coordina los fosfatos β y γ. Las PTP, que catalizan la hidrólisis de un fosfato inorgánico de un residuo de , también contienen un motivo de bucle P. La secuencia conservada de este motivo es CxxxxxR(S/T).
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The Walker A and Walker B motifs are protein sequence motifs, known to have highly conserved three-dimensional structures. These were first reported in ATP-binding proteins by Walker and co-workers in 1982. Of the two motifs, the A motif is the main "P-loop" responsible for binding phosphate, while the B motif is a much less conserved downstream region. The P-loop is best known for its presence in ATP- and GTP-binding proteins, and is also found in a variety of proteins with phosphorylated substrates. Major lineages include:
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Bucle P
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Motif de Walker
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Walkerモチーフ
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Walker motifs
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P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase
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IPR027417
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Un bucle P o bucle de unión a fosfato es un motivo de unión a ATP o GTP que se encuentra en muchas proteínas de unión de nucleótidos. Se trata de un bucle rico en glicina precedido de una lámina beta y seguido por una hélice alfa. Interactúa con los grupos fosfato de los nucleótidos y el ion Mg2+, que coordina los fosfatos β y γ. En las GTPasas pequeñas la secuencia consenso del bucle P es GxxxxGK (S/T), que suele denominarse motivo de Walker A. Tras una hidrólisis de nucleótidos, los bucles P no alteran significativamente su conformación, y se mantienen unidos a los restantes grupos de fosfato. Las PTP, que catalizan la hidrólisis de un fosfato inorgánico de un residuo de , también contienen un motivo de bucle P. La secuencia conservada de este motivo es CxxxxxR(S/T). Otras proteínas con bucles P funcionales son la ATP sintasa, la miosina, la y la helicasa.
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Les motifs de Walker sont des séquences d'acides aminés observés dans de nombreuses protéines et qui présentent une structure tridimensionnelle hautement conservée. Ces structures ont été décrites pour la première fois par Walker et al. en 1982.
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Walkerモチーフ(英: Walker motifs)は、高度に保存された三次構造を持つタンパク質配列モチーフであり、Walker AとWalker Bの2つのモチーフからなる。これらのモチーフは1982年にジョン・E・ウォーカーらによって、ATP結合タンパク質の比較から初めて報告された。
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The Walker A and Walker B motifs are protein sequence motifs, known to have highly conserved three-dimensional structures. These were first reported in ATP-binding proteins by Walker and co-workers in 1982. Of the two motifs, the A motif is the main "P-loop" responsible for binding phosphate, while the B motif is a much less conserved downstream region. The P-loop is best known for its presence in ATP- and GTP-binding proteins, and is also found in a variety of proteins with phosphorylated substrates. Major lineages include:
* RecA and rotor ATP synthase / ATPases (α and β subunits).
* Nucleic acid-dependent ATPases: helicases, Swi2, and PhoH (InterPro: IPR003714)
* AAA proteins
* STAND NTPases including MJ, PH, AP, and NACHT ATPases
* ABC-PilT ATPases
* Nucleotide kinases (InterPro: IPR000850)
* G domain proteins: G-proteins (transducin), myosin.
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