Short interspersed nuclear element
http://dbpedia.org/resource/Short_interspersed_nuclear_element
I short interspersed nuclear element, chiamati anche con l'acronimo di SINE, sono uno dei quattro tipi principali di trasposoni. Sono lunghi fino a circa 500 paia di basi. Sono trascritti ma non tradotti. Occupano circa il 15% del DNA. I SINE costituiscono circa il 13% del genoma dei mammiferi.
rdf:langString
Els elements nuclears intercalats curts (del anglès: Short interpersed nuclear elements, SINEs) són fragments d'ADN no codificants i transposables d'ADN. Són una classe de retrotransposons, elements d'ADN que s'amplifiquen autònomament per tot el genoma eucariota, sovint a través d'intermediaris d'ARN. L'anàlisi dels llinatges diferents, les mutacions i l'activitat dels SINEs és una eina molt útil en anàlisi filogenètica.
rdf:langString
Unter short interspersed nuclear elements (SINE, engl. für ‚kurze, eingestreute Kernsequenzelemente‘) versteht man typischerweise 100–400 Basenpaare lange, häufig wiederholte und relativ frei verteilte DNA-Sequenzen im Genom. SINEs werden häufig zu den transponierbaren Elementen gerechnet, die eine RNA als Zwischenstufe benutzen (Retroelement) und keine long terminal repeats (Non-LTR Retrotransposons) besitzen. Transponierbare Elemente im engeren Sinn sind jedoch definiert als DNA-Sequenzen, die selbst eine Transposase kodieren und damit eine intrinsische Fähigkeit besitzen, ihre genomische Position zu ändern. Im Gegensatz zu den längeren LINEs sind SINEs somit nicht autonom, sondern benötigen eine externe Reverse Transkriptase (oft von LINEs codiert), da sie keine eigene (mehr) besitzen.
rdf:langString
Short interspersed nuclear elements (SINEs) are non-autonomous, non-coding transposable elements (TEs) that are about 100 to 700 base pairs in length. They are a class of retrotransposons, DNA elements that amplify themselves throughout eukaryotic genomes, often through RNA intermediates. SINEs compose about 13% of the mammalian genome.
rdf:langString
Les éléments nucléaires dispersés courts (SINE, short interspersed nuclear elements) font partie des séquences répétées dispersées au sein de l'ADN. Parmi les plus connues de ces séquences, on trouve les séquences Alu qui contiennent le site de restriction (AG/CT) de l'enzyme de restriction AluI, d'où leur nom.
rdf:langString
短鎖散在反復配列（たんささんざいはんぷくはいれつ、英: Short interspersed nuclear element, SINE）とは、長さ100から700塩基対の、非自律型・転移因子をいう。レトロトランスポゾンの一種であり、しばしばRNAを媒介として自己増殖する。真核生物のゲノム上に多く見られる。 SINEの内部領域はtRNAに起因し、保存性が高いことからSINEの構造および機能が正の淘汰圧により保存されていることがうかがえる。SINEは脊椎動物・無脊椎動物双方の多くの種に存在するが、系列特異的であるため、種間のマーカーとして有用であり、SINE配列中のコピー数多型および突然変異を種間で比較することにより系統学的な研究を行うことができる。また、ヒトその他の真核生物における一連の遺伝子疾患にも関連する。
rdf:langString
Een short interspersed nuclear element, afgekort tot SINE (Engels voor kort verspreid kernelement) is een DNA-sequentie in het genoom dat typisch zo'n 100–400 basenparen lang is, veel herhaald (repeat) wordt en relatief vrij verspreid voorkomt. Evolutionair gezien zijn SINE's afgeleid van het kleine cytoplasmatische 7SL RNA, een component van het signaalherkenningdeeltje. Het menselijk genoom heeft ongeveer 1,5 miljoen SINE-copiën, die ongeveer 14% van het genoom uitmaken.
rdf:langString
SINEs (англ. Short interspersed nuclear element, Короткие Диспергированные Повторы) — короткие последовательности ДНК (менее 500 пар оснований) в геноме эукариот, появившиеся в результате обратной транскрипции коротких молекул РНК, транскрибируемых РНК-полимеразой III: 5S рРНК, тРНК и различные мяРНК. SINEs не кодируют белки, и их транспозиция в геноме зависит от других мобильных элементов. Выделяют 3 группы SINE в зависимости от того, какая РНК стала их предшественником.:
rdf:langString
短散在核元件（Short interspersed nuclear elements，簡稱SINE）是真核生物基因組中長100至700bp的轉位子序列，屬於反轉錄轉座子，哺乳類基因組約有13%為SINE。SINE與LINE等轉位子皆是「寄生」於生物基因組中的DNA元件，某些情況下可能對生物體有害，但有時細胞也將其用來調控自己的基因表現。 SINE一般不具有长末端重复序列（LTR），其序列從5端至3端可大致分為頭端、中端與尾端三部分，其中頭端大多來自tRNA等由RNA聚合酶III轉錄的RNA，例如Alu元件的5端序列即來自7SL RNA；中端序列常與長散在核元件（LINE）相似，因此可利用後者編碼的內切酶；尾端則是由一些重複序列組成。 Alu元件是靈長類演化過程中相當重要的SINE，約長300bp，人類基因組中有超過百萬個Alu元件，占基因組大小超過10%，許多其他動物基因組中也有大量的SINE。SINE插入重要的基因序列可影響基因表現而造成人類的遺傳疾病，例如有些乳癌、大腸癌、白血病、血友病、囊腫性纖維化、神經纖維瘤病與為Alu元件插入造成。
rdf:langString
rdf:langString
SINE
rdf:langString
Short Interspersed Nuclear Element
rdf:langString
Short interspersed nuclear element
rdf:langString
Élément nucléaire dispersé court
rdf:langString
短鎖散在反復配列
rdf:langString
Short interspersed nuclear element
rdf:langString
Short interspersed nuclear element
rdf:langString
SINEs
rdf:langString
短散在核元件
xsd:integer
49982814
xsd:integer
1124680319
rdf:langString
Els elements nuclears intercalats curts (del anglès: Short interpersed nuclear elements, SINEs) són fragments d'ADN no codificants i transposables d'ADN. Són una classe de retrotransposons, elements d'ADN que s'amplifiquen autònomament per tot el genoma eucariota, sovint a través d'intermediaris d'ARN. Les regions internes dels SINE s'originen de tRNAs i estan altament conservats, suggerint una pressió positiva per conservar l'estructura i la funció en la seva evolució. Encara que els SINE són presents en moltes espècies de vertebrats i invertebrats, són generalment específics d'un llinatge, fent-los molt útils per establir una línia evolutiva de espècies. Variacions de número de la còpies i mutacions en la seqüència dels SINEs han fet possible construir filogènies. Els SINEs són també implicats en certes malalties genètiques en éssers humans i altre eukaryotes. En essència, els SINEs són paràsits genètics que han evolucionat per utilitzar la maquinària cel·lular per multiplicar-se. La simplicitat d'aquests elements els fa increïblement exitosos a persistir i amplificar-se (a través de retrotranscripció) dins dels genomes dels eucariotes. Aquests “paràsits” que han esdevingut estesos en els genomes poden ser patològics pels organismes. Tanmateix, els eucatiores han estat capaços d'integrar els SINEs en processos com la senyalització diferencial, el metabolisme o les vies reguladores i han esdevingut una font gran de variabilitat genètica. Sembla que juguen una funció particularment important en el control d'expressió de gens i la creació de gens d'ARN. Aquest control s'estén a la reorganització de la cromatina i el control d'arquitectura genòmica. L'anàlisi dels llinatges diferents, les mutacions i l'activitat dels SINEs és una eina molt útil en anàlisi filogenètica.
rdf:langString
Unter short interspersed nuclear elements (SINE, engl. für ‚kurze, eingestreute Kernsequenzelemente‘) versteht man typischerweise 100–400 Basenpaare lange, häufig wiederholte und relativ frei verteilte DNA-Sequenzen im Genom. SINEs werden häufig zu den transponierbaren Elementen gerechnet, die eine RNA als Zwischenstufe benutzen (Retroelement) und keine long terminal repeats (Non-LTR Retrotransposons) besitzen. Transponierbare Elemente im engeren Sinn sind jedoch definiert als DNA-Sequenzen, die selbst eine Transposase kodieren und damit eine intrinsische Fähigkeit besitzen, ihre genomische Position zu ändern. Im Gegensatz zu den längeren LINEs sind SINEs somit nicht autonom, sondern benötigen eine externe Reverse Transkriptase (oft von LINEs codiert), da sie keine eigene (mehr) besitzen. SINEs stimmen in der 3'-Sequenz oftmals mit LINE-Sequenzen überein und sind oft entartete Gene für kleine RNAs, wie die 7SL-RNA, oder tRNAs. tRNA-verwandte SINEs besitzen eine zusammengesetzte Struktur mit einer Region, die homolog zu einer tRNA ist, einer nicht tRNA-ähnlichen Region sowie einem variablen (8–50 bp) AT-reichen 3'-Ende. Die tRNA-homologe Sequenz enthält einen RNA-Polymerase-III-Promotor. Sie werden demnach durch die RNA-Polymerase III transkribiert. Eine bedeutende SINE-Familie ist die sogenannte Alu-Familie, die nur in Primaten vorkommt. Andere Familien kommen bei sämtlichen Säugetieren (auch Kloakentiere und Beuteltiere) vor und werden daher auch als mammalian-wide interspersed repeats (MIR) bezeichnet. Bei einigen Organismen, wie z. B. der Fruchtfliege Drosophila melanogaster oder dem Nematoden Caenorhabditis elegans fehlen SINEs. SINEs machen im menschlichen Genom ca. 14 % aus. Auch in vielen pflanzlichen Genomen kommen SINEs vor. Zum Beispiel sind SINEs in verschiedenen Getreidearten in hoher Vielfalt und mit variierenden Kopienanzahlen verbreitet.
rdf:langString
Les éléments nucléaires dispersés courts (SINE, short interspersed nuclear elements) font partie des séquences répétées dispersées au sein de l'ADN. Parmi les plus connues de ces séquences, on trouve les séquences Alu qui contiennent le site de restriction (AG/CT) de l'enzyme de restriction AluI, d'où leur nom. Leur longueur est en général de quelques centaines de paires de bases et leur nature exacte varie suivant les espèces. Chez les primates, les principales séquences SINE sont les séquences Alu qui représentent environ les deux-tiers des 1 500 000 copies présentes dans leur génomes représentant 13 % du génome total (une toutes les 4 kb). Les séquences SINE sont transcrites à partir d'un promoteur interne (par l'ARN polymérase III pour les séquences Alu) et sont polyadénylées en 3'. Cet ARN intermédiaire est répliqué en ADN par rétrotranscription. Les séquences SINE sont courtes et ne comportent donc pas de séquences codant une transcriptase inverse, elles sont donc rétrotranscrites par une transcriptase agissant en trans. Les séquences Alu qui sont dispersées dans les introns pourraient jouer un rôle dans la recombinaison.
rdf:langString
Short interspersed nuclear elements (SINEs) are non-autonomous, non-coding transposable elements (TEs) that are about 100 to 700 base pairs in length. They are a class of retrotransposons, DNA elements that amplify themselves throughout eukaryotic genomes, often through RNA intermediates. SINEs compose about 13% of the mammalian genome. The internal regions of SINEs originate from tRNA and remain highly conserved, suggesting positive pressure to preserve structure and function of SINEs. While SINEs are present in many species of vertebrates and invertebrates, SINEs are often lineage specific, making them useful markers of divergent evolution between species. Copy number variation and mutations in the SINE sequence make it possible to construct phylogenies based on differences in SINEs between species. SINEs are also implicated in certain types of genetic disease in humans and other eukaryotes. In essence, short interspersed nuclear elements are genetic parasites which have evolved very early in the history of eukaryotes to utilize protein machinery within the organism as well as to co-opt the machinery from similarly parasitic genomic elements. The simplicity of these elements make them remarkably successful at persisting and amplifying (through retrotransposition) within the genomes of eukaryotes. These "parasites" which have become ubiquitous in genomes can be very deleterious to organisms as discussed below. However, eukaryotes have been able to integrate short-interspersed nuclear elements into different signaling, metabolic and regulatory pathways and SINEs have become a great source of genetic variability. They seem to play a particularly important role in the regulation of gene expression and the creation of RNA genes. This regulation extends to chromatin re-organization and the regulation of genomic architecture. The different lineages, mutations, and activities among eukaryotes make short-interspersed nuclear elements a useful tool in phylogenetic analysis.
rdf:langString
I short interspersed nuclear element, chiamati anche con l'acronimo di SINE, sono uno dei quattro tipi principali di trasposoni. Sono lunghi fino a circa 500 paia di basi. Sono trascritti ma non tradotti. Occupano circa il 15% del DNA. I SINE costituiscono circa il 13% del genoma dei mammiferi.
rdf:langString
短鎖散在反復配列（たんささんざいはんぷくはいれつ、英: Short interspersed nuclear element, SINE）とは、長さ100から700塩基対の、非自律型・転移因子をいう。レトロトランスポゾンの一種であり、しばしばRNAを媒介として自己増殖する。真核生物のゲノム上に多く見られる。 SINEの内部領域はtRNAに起因し、保存性が高いことからSINEの構造および機能が正の淘汰圧により保存されていることがうかがえる。SINEは脊椎動物・無脊椎動物双方の多くの種に存在するが、系列特異的であるため、種間のマーカーとして有用であり、SINE配列中のコピー数多型および突然変異を種間で比較することにより系統学的な研究を行うことができる。また、ヒトその他の真核生物における一連の遺伝子疾患にも関連する。 SINEは本質的には、真核生物の歴史の非常に早い段階で進化した、遺伝的寄生者とみることができ、生物内のタンパク質機構を利用し、他の寄生的遺伝要素との共選択も起こす。これらの要素は、その単純さにゆえに真核生物のゲノム内で（レトロトランスポーズを介して）存在しつづけ、増幅することに大きく成功した。これらの「寄生者」がゲノム中に広がることは、後述のとおり生物にとって非常に有害である場合もある。しかし、真核生物ではSINEはさまざまなシグナル伝達、代謝、および調節経路に統合することに成功し、そのことが遺伝的多様性の大きな源となった。SINE は遺伝子発現の調節およびRNA遺伝子の生成において特に重要な役割を果たすと考えられている。SINEの関わる調節には、クロマチンの再編成やゲノムアーキテクチャの調節なども含まれる。
rdf:langString
Een short interspersed nuclear element, afgekort tot SINE (Engels voor kort verspreid kernelement) is een DNA-sequentie in het genoom dat typisch zo'n 100–400 basenparen lang is, veel herhaald (repeat) wordt en relatief vrij verspreid voorkomt. Evolutionair gezien zijn SINE's afgeleid van het kleine cytoplasmatische 7SL RNA, een component van het signaalherkenningdeeltje. SINE's worden vaak tot de springende gen-elementen gerekend die een RNA als tussenstap gebruiken (retro-element) en geen long terminal repeats (Non-LTR Retrotransposons) hebben. In tegenstelling tot de langere long interspersed nuclear elements (LINE's) zijn SINE's niet autonoom maar hebben een externe reverse-transcriptase (vaak van LINE's gecodeerd) nodig, daar ze er zelf geen (meer) bezitten. Daarmee zijn ze in engere zin . In sommige gevallen hebben de SINE's een eigen endonuclease, waarmee ze in het genoom van de gastheer kunnen integreren. Het menselijk genoom heeft ongeveer 1,5 miljoen SINE-copiën, die ongeveer 14% van het genoom uitmaken. De SINE Alu-familie komt alleen voor bij primaten. Andere SINE-families komen bij verscheidene zoogdieren (ook Cloacadieren en buideldieren) voor en worden daarom ook wel mammalian-wide interspersed repeats (MIR) genoemd. Bij enkele organismen, zoals bijvoorbeeld de fruitvlieg Drosophila melanogaster of de rondworm Caenorhabditis elegans ontbreken SINE's.
rdf:langString
SINEs (англ. Short interspersed nuclear element, Короткие Диспергированные Повторы) — короткие последовательности ДНК (менее 500 пар оснований) в геноме эукариот, появившиеся в результате обратной транскрипции коротких молекул РНК, транскрибируемых РНК-полимеразой III: 5S рРНК, тРНК и различные мяРНК. SINEs не кодируют белки, и их транспозиция в геноме зависит от других мобильных элементов. Выделяют 3 группы SINE в зависимости от того, какая РНК стала их предшественником.:
* SINE, произошедшие от тРНК (обычны у беспозвоночных и позвоночных животных, у многих цветковых растений);
* SINE, произошедшие от 7SL РНК (встречаются только у грызунов, приматов и тупайи);
* SINE, произошедшие от 5S рРНК (найдены у некоторых рыб и у некоторых млекопитающих).
rdf:langString
短散在核元件（Short interspersed nuclear elements，簡稱SINE）是真核生物基因組中長100至700bp的轉位子序列，屬於反轉錄轉座子，哺乳類基因組約有13%為SINE。SINE與LINE等轉位子皆是「寄生」於生物基因組中的DNA元件，某些情況下可能對生物體有害，但有時細胞也將其用來調控自己的基因表現。 SINE一般不具有长末端重复序列（LTR），其序列從5端至3端可大致分為頭端、中端與尾端三部分，其中頭端大多來自tRNA等由RNA聚合酶III轉錄的RNA，例如Alu元件的5端序列即來自7SL RNA；中端序列常與長散在核元件（LINE）相似，因此可利用後者編碼的內切酶；尾端則是由一些重複序列組成。 SINE頭端的序列與tRNA等小RNA相似，可被RNA聚合酶III轉錄，且其啟動子和tRNA一樣是轉錄序列的一部份（稱為「內部啟動子」），而非位於其上游。SINE轉錄出的mRNA不編碼任何蛋白質，相較之下LINE可編碼具內切酶和反轉錄酶活性的蛋白，SINE因具有和LINE同源的序列，其RNA跟LINE的RNA均可利用這些蛋白，反轉錄成DNA後再隨機插入基因組中。SINE因需仰賴基因組中的其他序列編碼的酵素才能增殖，屬於非自主的逆转录转座子（non-autonomous retrotransposon），而LINE則是自主的逆转录转座子（autonomous retrotransposon）。LINE的轉錄在和早期胚胎中較為活躍，因此SINE也大多在這些階段轉錄增殖，胚胎發育後期以後，體細胞中SINE的轉錄一般會被抑制，不過某些狀況下可能使其恢復表現。 Alu元件是靈長類演化過程中相當重要的SINE，約長300bp，人類基因組中有超過百萬個Alu元件，占基因組大小超過10%，許多其他動物基因組中也有大量的SINE。SINE插入重要的基因序列可影響基因表現而造成人類的遺傳疾病，例如有些乳癌、大腸癌、白血病、血友病、囊腫性纖維化、神經纖維瘤病與為Alu元件插入造成。
xsd:nonNegativeInteger
41898
