SARS-related coronavirus

rdf:langString Coronavirus lié au syndrome respiratoire aigu sévère

rdf:langString SARS-CoV

rdf:langString Coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère( Ne doit pas être confondu avec SARS-CoV-2 ou MERS-CoV. )( Cet article concerne le coronavirus lui-même. Pour la maladie associée, voir syndrome respiratoire aigu sévère. ) SARS-CoV Virions de virus SARS-CoV vus par microscopie électronique à balayage. Forme SARS-CoV(Coronavirus associé au syndrome respiratoire aigu sévère)ICTV Classification phylogénétique Position : * Espèce : SARSr-CoV * * * * * SARSr-CoV WIV1 * * * SARSr-CoV RsSHC014 * * * (agent du SRAS) * * * * SARSr-CoV RaTG13 * * * SARS-CoV-2 (agent de la COVID-19)Animal hôte : * chauve-souris * humain Le coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère, SARS-CoV (acronyme anglais de severe acute respiratory syndrome coronavirus), SARS-CoV-1 (pour bien le différencier du SARS-CoV-2 apparu en 2019) ou SARS-CoV Urbani d'après son découvreur, est le coronavirus responsable de l'épidémie de syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS) qui a sévi de 2002 à 2004. C'est une souche de l'espèce de coronavirus SARSr-CoV (pour SARS-related coronavirus, soit « coronavirus lié à un SRAS »). Cet agent infectieux serait apparu en novembre 2002 dans la province du Guangdong, en Chine. Entre le 1er novembre 2002 et le 31 août 2003, le virus aurait infecté 8 096 personnes dans une trentaine de pays, causant 774 décès, essentiellement en Chine, à Hong Kong, à Taïwan et en Asie du Sud-Est. Issu d'une espèce de coronavirus bien implantée chez les chauve-souris (Rhinolophes), le SARS-CoV-1 infecte civettes, blaireaux et humains. Il s'agit d'un virus à ARN monocaténaire de polarité positive (groupe IV de la classification Baltimore) appartenant au genre des Betacoronavirus. Ce virus enveloppé présente un génome long d'environ 29,7 kilobases, ce qui est l'un des plus grands génomes parmi les virus à ARN. On y a identifié 13 gènes codant 14 protéines. La région 5'-UTR compte 265 nucléotides tandis que la région 3'-UTR en compte 342. Comme pour d'autres coronavirus, l'expression de ce génome commence par la transcription de deux grands cadres de lecture ouverts (ORF), notés 1a et 1b, qui sont tous les deux traduits en polyprotéines. On connaît la fonction de plusieurs de ces protéines. Les cadres de lecture ouverts 1a et 1b codent l'ARN polymérase ARN-dépendante et quatre protéines structurelles importantes : la protéine N de nucléocapside, la protéine S de spicule, la protéine M de membrane et la protéine E d'enveloppe. Il existe également huit protéines dites accessoires dont aucune n'a d'homologue connu. La fonction de ces protéines accessoires demeure obscure. Les coronavirus expriment généralement les polyprotéines pp1a et pp1ab avec les cadres de lecture ouverts 1a et 1b. Ces polyprotéines sont ensuite traitées par des enzymes codées dans l'ORF 1a. Parmi les protéines issues du traitement des polyprotéines par ces enzymes, on compte plusieurs enzymes de réplication telles qu'une ARN polymérase ARN-dépendante, une hélicase et une peptidase. Le complexe de réplication des coronavirus est également responsable de la synthèse de divers ARN messagers en aval du cadre de lecture ouvert 1b, qui donnent des protéines structurelles et accessoires. Deux protéines distinctes, 3CLpro et PL2pro, clivent les grandes polyprotéines en 16 sous-unités plus petites. Ce génome ne contient pas de gène codant l'hémagglutinine estérase, présente chez les coronavirus de classe II.

rdf:langString SARSr-CoV( Ne doit pas être confondu avec SARS-CoV ou SARS-CoV-2. ) SARSr-CoV Virions de virus SARS-CoV vus par microscopie électronique à balayage. Espèce Coronavirus liés au syndrome respiratoire aigu sévère (SARSr-CoV)ICTV Formes de rang inférieur * SARS-CoV-1 * SARS-CoV-2 * * Bat SL-CoV WIV1 * Bat SL-CoV RsSHC014 * Bat SL-CoV RaTG13 (…) * Pangolin SL-CoV GD * Cat SL-CoV * Tiger SL-CoV * Mink SL-CoV * Dog SL-CoV SARSr-CoV (acronyme anglais de severe acute respiratory syndrome-related coronavirus) est le nom scientifique officiel de l'espèce de coronavirus liés au syndrome respiratoire aigu sévère (soit également SL-CoV, pour SARS-like coronavirus). Ce sont, par exemple, le virus du SRAS de 2003 ou celui du Covid-19. Les différentes formes de ces coronavirus infectent les humains, les chauves-souris et d'autres mammifères. Il s'agit d'un virus à ARN simple brin de sens positif enveloppé qui pénètre dans sa cellule hôte en se liant au récepteur ACE2. Il est membre du genre Betacoronavirus et du sous-genre Sarbecovirus, différent de celui du coronavirus causant le MERS. Deux souches de SARSr-CoV ont provoqué des flambées de maladies respiratoires graves chez l'humain : le SARS-CoV, qui a provoqué une flambée de syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS) entre 2002 et 2003, et le SARS-CoV-2, qui depuis fin 2019 a provoqué une pandémie de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19). Il existe des centaines d'autres souches de SARSr-CoV, qui sont connues pour n'infecter que des espèces non humaines : les chauves-souris sont un réservoir majeur de nombreuses souches de SARSr-CoV, et plusieurs souches ont été identifiées dans les civettes de palmier, qui étaient les ancêtres probables du SARS-CoV. Le SARSr-CoV était l'une des nombreuses espèces virales identifiées par l'Organisation mondiale de la santé (OMS) en 2016 comme une cause probable d'une future épidémie dans un nouveau plan élaboré après l'épidémie d'Ebola pour la recherche et le développement urgents de tests de dépistage, vaccins et médicaments. La prédiction s'est réalisée avec la pandémie de Covid-19.