Phase variation
http://dbpedia.org/resource/Phase_variation an entity of type: Software
مرحلة التنوع في البكتيريا مرحلة التنوع هي طريقة التعامل مع بيئات مختلفة بسرعة دون الحاجة لتغييرات عشوائية التي تستخدمها مختلف أنواع البكتيريا، بما في ذلك الأنواع السالمونيلا وهو ينطوى على تنوع تعبير البروتين في كثير من الأحيان بصورة متقطعة في أجزاء مختلفة من البكتيريا. على الرغم من انه كان الأكثر شيوعا في دراستها في سياق التهرب من المناعة وقد لوحظ في كثير من المجالات الأخرى أيضا. تعرف مرحلة التباين على أنها تبديل عشوائي في الطرز الشكلية في ترددات أعلى بكثير (أحياناً >1%) من معدلات الطفرات الكلاسيكية. وتساهم المرحلة التباين في خبثها، عن طريق توليد التباين إعادة تركيب موقع معين: العكس:
rdf:langString
En biología, la variación de fase es un método para lidiar con entornos que varían rápidamente sin requerir una mutación aleatoria. Implica la variación de la expresión de proteínas, frecuentemente de forma intermitente, dentro de diferentes partes de una población bacteriana. Como tal, el fenotipo puede cambiar a frecuencias que son mucho más altas (a veces> 1%) que las tasas de mutación clásicas. La variación de fase contribuye a la virulencia al generar heterogeneidad. Aunque se ha estudiado con mayor frecuencia en el contexto de la evasión inmune, también se observa en muchas otras áreas y es empleado por varios tipos de bacterias, incluidas las especies de Salmonella.
rdf:langString
In biology, phase variation is a method for dealing with rapidly varying environments without requiring random mutation. It involves the variation of protein expression, frequently in an on-off fashion, within different parts of a bacterial population. As such the phenotype can switch at frequencies that are much higher (sometimes >1%) than classical mutation rates. Phase variation contributes to virulence by generating heterogeneity. Although it has been most commonly studied in the context of immune evasion, it is observed in many other areas as well and is employed by various types of bacteria, including Salmonella species.
rdf:langString
相変異（そうへんい、英: phase variation, phase polymorphism）とは、ランダムな突然変異を必要とせずに急速に変化する環境に対処するための、生物学的な現象の一つである。相変異では、細菌集団内の各部分集団において、On-Offスイッチングによるタンパク質発現変動が起きる。古典的な突然変異率よりもはるかに高い頻度（場合によっては>1 %）で表現型の切り替えが起きる可能性がある。相変異は、細胞集団に不均一性をもたらすため、例えば病原性細菌の生態を考える上で重要である。以前は免疫回避の文脈で研究が進められてきたが、病原性細菌以外の微生物でも相変異が広くみられることから、サルモネラ種を含むさまざまな細菌種において研究が進められている。
rdf:langString
rdf:langString
مرحلة التنوع في البكتيريا
rdf:langString
Variación de fase
rdf:langString
相変異 (細菌)
rdf:langString
Phase variation
xsd:integer
15397737
xsd:integer
1090050836
rdf:langString
مرحلة التنوع في البكتيريا مرحلة التنوع هي طريقة التعامل مع بيئات مختلفة بسرعة دون الحاجة لتغييرات عشوائية التي تستخدمها مختلف أنواع البكتيريا، بما في ذلك الأنواع السالمونيلا وهو ينطوى على تنوع تعبير البروتين في كثير من الأحيان بصورة متقطعة في أجزاء مختلفة من البكتيريا. على الرغم من انه كان الأكثر شيوعا في دراستها في سياق التهرب من المناعة وقد لوحظ في كثير من المجالات الأخرى أيضا. تعرف مرحلة التباين على أنها تبديل عشوائي في الطرز الشكلية في ترددات أعلى بكثير (أحياناً >1%) من معدلات الطفرات الكلاسيكية. وتساهم المرحلة التباين في خبثها، عن طريق توليد التباين ستخدم هذا الأسلوب السالمونيلا للتبديل بين أنواع مختلفة من البروتين الاسواط ونتيجة لذلك، توجد هياكل الاسواط مختلفة في تركيبها. مرة واحدة وقد شنت استجابة تكيفية ضد نوع واحد من الاسواط، أو إذا كان لقاء سابق قد غادر نظام المناعة التكيفية يجب على الجهاز الاستعداد للتعامل مع نوع واحد من الأسواط، والتحول أنواع يجعل الأجسام المضادة الثانوية سابقا تقارب، TCRs، وBCRs غير فعالة ضد سياط. إعادة تركيب موقع معين: إعادة تركيب موقع معين وعادة ما تكون قصيرة وتحدث في موقع هدف واحد ضمن تسلسل إعادة توحيد. لهذا حتى يحدث يجب أن يكون هناك عادة واحد أو أكثر من العوامل المساعدة (على سبيل المثال لا حصر لها: البروتينات ملزمة الحمض النووي ووجود أو عدم وجود مواقع الربط الحمض النووي). و مواقع محددة لجينات انزيم إعادة التركيب [1] هناك تغيير في التوجه من الحمض النووي التي من شأنها أن تؤثر على التعبير الجيني أو التركيب الجيني المنتج.[2] ويتم ذلك عن طريق تغيير الترتيب المكاني لمبدأ عملية الترجمة أوعناصرتنظيم عملية الترجمة. العكس: من خلال الاستفادة من انزيم إعادة التركيب محدده، يمكن قلب تسلسل من الحمض النووي، مما أدى إلى ON إلى OFF التبديل والعكس بالعكس من الجينات التي تقع داخل أو بجوار لهذا التحول. يمكن للعديد من الأنواع البكتيرية الاستفادة انعكاس لتغيير ترجمة بعض الجينات معينة لصالح من البكتيريا خلال العدوى .يمكن أن يكون هذا الانعكاس بسيطة بواسطة ان تنطوي الترجمة على جين واحد، مثل ترجمة الاهداب لبكتيريا (E.coli) ، أو أكثر تعقيداً بواسطة ان ينطوي على العديد من الجينات في ترجمة العديد من الاسواط بواسطة (S. typhimurium) التصاق الاسواط من الأنواع الأول الاسواط في بكتيريا (E.coli) يخضع لعملية العكس موقع محدد لتنظيم ترجمة جين (fimA) ، الوحيدات الرئيسية من الاهداب، يعتمدعلى مرحلة العدوى. الجينات المعكوسة لها مبدأ(promoter) بداخلها التي يعتمد عليها بدأ عملية الترجمة أو ايقافها لجين الذي ينتج (fimA). عملية الترجمة يتوسطها انزيمان إعادة التركيب هما، FimBو FimE، والبروتينات التنظيمية H-NS، (IHF)، وليسين البروتين استجابة (LRP). Fim Eلديه القدرة على عكس عنصر فقط وتحويل الترجمة من التشغيل إلى ايقاف، بينما يمكن FiMB يمكن أن يتوسط عملية العكس في كلا الاتجاهين. الإدخال_الاستئصال: إذا عملية القطع(excision) دقيقة ويتم استعادة تسلسل الأصلي من الحمض النووي، وعكسها مرحلة الاختلاف يمكن بوساطة عملية التبديل (transposition) . تباين المرحلة بوساطة عملية التبديل يستهدف تسلسل الحمض النووي محددة [5] تحتوي البكتيريا (P. atlantica)على موقع معين في الحمض النووي(.eps) الذي يشفر السكاريد (مركب خارجي يكون موجود على سطح البكتيريا ) خارج الخلية. عملية ترجمة هذا الموقع يتم السيطرة عليه بواسطة مركب يسمى(IS492)وجوده أو غيابه يؤثر على عملية الترجمة. اثنين من الانزيمات _الذي يعزز إعادة التركيب الجيني _ يشفران بواسطة(MooV and Piv) تتوسطه عملية الاستئصال الدقيق والإدراج، على التوالي، إدراج(IS492)في موقع معين من الحمض النووي (eps). عندما يتم استئصاله IS492 يصبح خارج الكروموسوم الدائري الذي ينتج عن ازالته ترجمة موقع معين من الحمض النووي (eps.).[6][5]مثال آخر أكثر تعقيدا على إعادة ترتيب موقع معين في DNA هو سياط الموجود في البكتيريا . في المرحلة المعتادة، سلسلة البرومتير(المنطقة التي تبدأ عملية الترجمة) يحفز على ترجمة الجينات لإنتاج سياط H2 مع ريبرسر _(repressor )(سلسة من RNA يعمل على تثبيط إنتاج سلسة mRNA) _من H1 الجينات سياط. مرة واحدة قلب سلسلة البرومتر بواسطة الجينات هين يتم تشغيل (repressor) وهو H2 يسمح ل H1 بترجمته. تحويل الجينات: تحويل الجين هو مثال آخر على نوع من التباين المرحلة. يتم التحكم في النوع الرابع من الاسواط(pili) لبكتيريا السيلان بهذه الطريقة. هناك عدة نسخ من الجين الترميز لهذه الاسواط (الجين بيل) ولكن تتم عملية الترجمة عن جين واحد فقط في أي وقت من الأوقات.والإصدارات الصامتة من هذا الجين(pils)، ويمكن استخدامها في إعادة التركيب المثلي بأن تتحد مع أجزاء من الجين (pilE) وبالتالي يساعد في خلق النمط الظاهري مختلفة. هذا يسمح تصل عدد الانماط الظاهرية المختلفة إلى 10,000,000 من (Pil) التعديل الجيني – مثلايشن: وخلافا لغيرها من الآليات من التباين المرحلة، تعديلات جينية لا يعمل على تغير تسلسل الحمض النووي، وبالتالي فإنه النمط الظاهري الذي يتغير وليس النمط الجيني. الجين يبقى سليم ولكن الذي يتغير المركبات التي تكون مربوطة على جين في حال ربط مجموعة مثيلين يؤثر على عملية النسخ. والنتيجة هي أن تنظيم عملية النسخ مما أدى إلى تنظيم عملية ترجمة الجينات إلى بروتينات[6][5].يتم التحكم بالبروتينات المضادة(43 (Ag43)) الموجود على السطح الخارجي للبكتيريا E.Coli بواسطة مرحلة التباين الذي يتوسطه نوعين من البروتينات. DNA-methylatingانزيم منزوع الأكسجين ناقل لمجموعة المثيل والإجهاد التأكسدي منظم OxyR. Ag43 وهما يقعان على سطح الخلية ويتم تشفيرهما بواسطة جين يسمى(the Agn43) ، وهذا الجين مهم لتكوين البيوفلم (غشاء حيوي رقيقs) والعدوى. وترجمة الجين (the Agn43) يعتمد على ربط البروتين المنظم يسمى(OxyR)، عندما يكون هذا البروتين مربوط بالمنطقة المنظمة للجين(Agn43) يتم تثبيط عملية النسخ. عملية نسخ تعتمد على وجود مجموعة ميثل في بداية الجين Agn43)) على موقع يسمى (GATC) فعند وجود مجموعة ميثل على (GATC) يمنع (OxyR) من الربط على الجين وهذا يسمح ببداية عملية النسخ للجين(Agn43).[7] انعكاس الحمض النووي المتداخل: في هذا الشكل من مرحلة الاختلاف. يمكن نقل منطقة البرومتر (promoter) في الجين من نسخة جينية واحدة إلى آخر من خلال إعادة التركيب المتشابه.وهذا يحدث في البروتينات السطحية للجنين. العديد من البروتينات السطحية المضادة المختلفة كلها صامتة وبصرف النظر عن مشاركة كل واحد في المنطقة المحفوظة في نهاية الجين(5') . يمكن لسلسلة البرومتر(promoter) ان تنتقل بين هذه المناطق الحافظة وهذا يسمح في ترجمة جينات مختلفة. تراجع سلسلة الحمض النووي: وهي عملية يتم من خلالها إنتاج سلسلة من الحمض النووي قصيرة بين سلسلة الحمض للام وسلسلة الحمض النووي للأبناء أثناء عملية تكوين الحمض النووي.[1] يمكن أن ترشح هذه الآلية المستقلة RecA)) أثناء عملية نسخ المتماثل للحمض النووي أوأثناء عملية اصلاح الحمض النووي، ويمكن أن تكون رائدة أو حبلا متخلفة.ويمكن أن ينتج عن هذه العملية سلاسل متكررة وقصيرة. وتتكون هذه السلسلة القصيرة المتكررة من 1-7 نيوكلوتيدات ويمكن أن تكون متجانسة أو غير متجانسة من التسلسل الحمض النووي المتكرر.[3] تغيير ترجمة الجينات ينتج عن عملية تراجع سلسلة الحمض النووي ويعتمد على مكان حدوث الزيادة أو نقصان من السلسلة القصيرة المتكررة المتعلقة في البرومتر(promoter) وهذا يؤدي إلى اما ان ينظم مستوى الترجمة أو النسخ[8] ، والنتيجة تكون ايقاف أو تشغيل مرحلة التغير. تنظيم عملية الترجمة يمكن أن تحدث في عدة طرق، وواحد من هذه الطرق الممكن هو إذا التكرر موجود في منطقة البرومتر (promoter) في بلمرة RNA .الأمراض الانتهازية (H. influenzae) تمتلك اثنين من البرومتر الموجه وجينات الخاملة (hifA و hifB).مناطق البرومتر المتداخلة تكرر اثنين من النيوكلوتيدات (A,T) من 10 إلى 35 في السلسلة. أثناء عملية تراجع سلسلة الحمض النووي المنطقة المعادة (T,A) يمكن أن تخضع لعملية إضافة أو حذف تيوكلوتيدات (T,A) الذي ينتج عنها ايقاف أو تشغيل مرحلة نسخ الجينات (hifA و hif). [9][3] أما الطريقة الثانية، عملية تراجع سلسلة الحمض النووي أن تستحث أو تحفز تنظيم الترجمة عن طريق تغير السلاسل القصيرة المتكرر الواقعة خارج البرومتر.إذا كان هناك تغير سلاسل القصيرة المتكررة يمكن أن يؤثر على عملية ربط البروتينات المنظمة مثل المنشط والقامع. وأيضا يمكن أن يؤدي إلى الاختلاف في الاستقرار بعد النسخي من RNA.[5] ترجمة البروتين يمكن أن تنظم عن طريق عملية تراجع سلسلة الحمض النووي إذا كانت السلاسل القصيرة المتكرر في منطقة الترجمة من الجين. تغير عدد المتكررات إطار القراءة المفتوح يمكن أن يؤثر على سلسلة الكودون عن طريق إضافة كودونات توقف سابقة لأوانها أوعن طريق تغير تسلسل البروتينات. وهذا غالبا ينتج عنه بروتينات ليس لديها وظيفة أو غير طبيعية.
rdf:langString
En biología, la variación de fase es un método para lidiar con entornos que varían rápidamente sin requerir una mutación aleatoria. Implica la variación de la expresión de proteínas, frecuentemente de forma intermitente, dentro de diferentes partes de una población bacteriana. Como tal, el fenotipo puede cambiar a frecuencias que son mucho más altas (a veces> 1%) que las tasas de mutación clásicas. La variación de fase contribuye a la virulencia al generar heterogeneidad. Aunque se ha estudiado con mayor frecuencia en el contexto de la evasión inmune, también se observa en muchas otras áreas y es empleado por varios tipos de bacterias, incluidas las especies de Salmonella. Salmonella utiliza esta técnica para cambiar entre diferentes tipos de proteína . Como resultado, se ensamblan flagelos con diferentes estructuras. Una vez que se ha montado una respuesta adaptativa contra un tipo de flagelina, o si un encuentro previo ha dejado al sistema inmunológico adaptativo listo para lidiar con un tipo de flagelina, el cambio de tipos hace que los anticuerpos, TCR y BCR de alta afinidad previamente sean ineficaces contra los flagelos.
rdf:langString
In biology, phase variation is a method for dealing with rapidly varying environments without requiring random mutation. It involves the variation of protein expression, frequently in an on-off fashion, within different parts of a bacterial population. As such the phenotype can switch at frequencies that are much higher (sometimes >1%) than classical mutation rates. Phase variation contributes to virulence by generating heterogeneity. Although it has been most commonly studied in the context of immune evasion, it is observed in many other areas as well and is employed by various types of bacteria, including Salmonella species. Salmonella use this technique to switch between different types of the protein flagellin. As a result, flagella with different structures are assembled. Once an adaptive response has been mounted against one type of flagellin, or if a previous encounter has left the adaptive immune system ready to deal with one type of flagellin, switching types renders previously high affinity antibodies, TCRs, and BCRs ineffective against the flagella.
rdf:langString
相変異（そうへんい、英: phase variation, phase polymorphism）とは、ランダムな突然変異を必要とせずに急速に変化する環境に対処するための、生物学的な現象の一つである。相変異では、細菌集団内の各部分集団において、On-Offスイッチングによるタンパク質発現変動が起きる。古典的な突然変異率よりもはるかに高い頻度（場合によっては>1 %）で表現型の切り替えが起きる可能性がある。相変異は、細胞集団に不均一性をもたらすため、例えば病原性細菌の生態を考える上で重要である。以前は免疫回避の文脈で研究が進められてきたが、病原性細菌以外の微生物でも相変異が広くみられることから、サルモネラ種を含むさまざまな細菌種において研究が進められている。 サルモネラ属菌における相変異では、さまざまな種類のフラジェリンタンパク質を切り替え、その結果として異なる構造のべん毛が組み立てられる。宿主側で特定のフラジェリンタイプに対する適応応答が進んだり、または宿主の適応免疫システムが特定タイプのフラジェリンを攻撃されるようになった時、相変異によってフラジェリンタイプを切り替えることで、以前のタイプでは高親和性を示していた抗体やTCR、BCRからの攻撃を回避することができるようになる。このメカニズムを利用して、サルモネラ菌は宿主からの免疫応答により集団が全滅することを回避している。サルモネラ属菌の他に大腸菌 (Escherichia coli) や淋菌 (Neisseria gonorrhoeae) などで認められる。
xsd:nonNegativeInteger
12163
