Nanopore sequencing
http://dbpedia.org/resource/Nanopore_sequencing an entity of type: Software
Nanopore sequencing is a third generation approach used in the sequencing of biopolymers — specifically, polynucleotides in the form of DNA or RNA. Using nanopore sequencing, a single molecule of DNA or RNA can be sequenced without the need for PCR amplification or chemical labeling of the sample. Nanopore sequencing has the potential to offer relatively low-cost genotyping, high mobility for testing, and rapid processing of samples with the ability to display results in real-time. Publications on the method outline its use in rapid identification of viral pathogens, monitoring ebola, environmental monitoring, food safety monitoring, human genome sequencing, plant genome sequencing, monitoring of antibiotic resistance, haplotyping and other applications.
rdf:langString
奈米孔定序（英語：Nanopore sequencing），又稱奈米孔定序，是一種針對核酸（RNA與DNA）進行测序的第三代定序技術。奈米孔定序技術不同於過去的基因定序技術，無須對樣品進行聚合酶链式反应或化學標記即可對一條DNA或RNA分子進行定序。奈米孔定序可以相對低廉的成本對個體進行基因型分型成本相對低廉，並具可攜帶性高、樣品處理的過程簡易快速與可以即時分析結果等優點。目前奈米孔定序已被廣泛應用在各種領域，如病原體的快速檢測、監測伊波拉病毒爆發的情況、環境微生物監測、食品安全監控、人類基因體定序、植物基因體定序、抗生素抗藥性檢測 、單倍型分析及其他相關應用。
rdf:langString
ما زالت سلسلة ثقب النانو (بالإنجليزية: Nanopore sequencing) في نطاق التطوير منذ عام 1995 ، بهدف تحديد الترتيب الذي تحدث فيه النوكليوتيدات (النوويدات) في الحمض النووي. وهنا نلاحظ أن ثقب النانو ما هو إلا ثقبٌ صغيرٌ، لا تزيد أبعاده عن القطر الداخلي عن واحد نانومتر. هذا وتُعَدُ بعض البروتينات الخلوية عبر الأغشية بمثابة ثقابٍ نانويةٍ، كما أنه يمكن تكوين الثقوب النانوية من خلال خرط ثقبٍ كبيرٍ إلى حدٍ ما (تصل أبعاده إلى عشراتٍ معدودةٍ من النانومترات) وذلك ضمن قطعةٍ من السيليكون، ثم يتم ملئها تدريجياً باستخدام طرائق (بالإنجليزية: Ion-beam sculpting) والتي ينجم عنها ثقباً أصغر بكثيرٍ في قطره: وهو ما يُعْرَفُ باسم ثقب النانو.
rdf:langString
La secuenciación por nanoporos es un método para determinar el orden en el que los nucleótidos se organizan en una hebra de ADN. Este método está en desarrollo desde 1995. Es un método de análisis simple y directo de ADN que hará que las pruebas genéticas sean cada vez más habituales. Consiste en generar nanoporos entre dos compartimientos y a través de la observación de los cambios en la corriente eléctrica dentro del nanoporo debida a los iones que pasan de un compartimiento al otro, identificar los nucleótidos que pasan dentro del mismo.
rdf:langString
Sekuensing nanopore adalah pendekatan generasi ketiga yang digunakan dalam proses sekuensing biopolimer - khususnya polinukleotida dalam bentuk DNA atau RNA. Dengan melakukan sekuensing nanpore, molekul DNA atau RNA tunggal dapat disekuensi tanpa memerlukan amplifikasi PCR atau pelabelan kimia pada sampel. Paling tidak salah satu langkah ini diperlukan dalam prosedur sekuensing yang telah dikembangkan sebelumnya. Sekuensing nanopore memiliki potensi sebagai metode yang relatif murah, memiliki mobilitas yang tinggi dalam proses pengujian, serta memiliki waktu pemrosesan yang cepat. Publikasi mengenai metode sekuensing nanopore menjabarkan kegunaannya dalam identifikasi patogen virus secara cepat, pengawasan ebola, pengawasan lingkungan, pengawasan ketahanan pangan, sekuensing genom manusia
rdf:langString
Le séquençage de l'ADN par les nanopores est une méthode utilisée depuis 1995. Elle permet de déterminer l'ordre dans lequel les nucléotides sont disposés sur un fragment d'ADN donné à l'aide de nanopores (trou avec un diamètre de l'ordre du nanomètre). Des protéines cellulaires transmembranaires possédant des petits pores peuvent agir comme des nanopores. Des nanopores peuvent également être construits dans un résidu de silicium simplement en y effectuant un trou d'une dizaine de nanomètres. Le morceau de silicium est par la suite rempli lentement par à l'aide de .
rdf:langString
Нанопо́ровое секвени́рование — семейство высокоэффективных методов секвенирования ДНК или РНК третьего поколения. Метод основан на использовании белковых, твердотельных или иных пор диаметром в несколько нанометров, чувствительных к нуклеиновым кислотам.
rdf:langString
rdf:langString
سلسة ثقب النانو
rdf:langString
Secuenciación de nanoporos
rdf:langString
Sekuensing nanopore
rdf:langString
Séquençage par nanopores
rdf:langString
Nanopore sequencing
rdf:langString
Нанопоровое секвенирование
rdf:langString
奈米孔洞測序
xsd:integer
733009
xsd:integer
1123483234
rdf:langString
ما زالت سلسلة ثقب النانو (بالإنجليزية: Nanopore sequencing) في نطاق التطوير منذ عام 1995 ، بهدف تحديد الترتيب الذي تحدث فيه النوكليوتيدات (النوويدات) في الحمض النووي. وهنا نلاحظ أن ثقب النانو ما هو إلا ثقبٌ صغيرٌ، لا تزيد أبعاده عن القطر الداخلي عن واحد نانومتر. هذا وتُعَدُ بعض البروتينات الخلوية عبر الأغشية بمثابة ثقابٍ نانويةٍ، كما أنه يمكن تكوين الثقوب النانوية من خلال خرط ثقبٍ كبيرٍ إلى حدٍ ما (تصل أبعاده إلى عشراتٍ معدودةٍ من النانومترات) وذلك ضمن قطعةٍ من السيليكون، ثم يتم ملئها تدريجياً باستخدام طرائق (بالإنجليزية: Ion-beam sculpting) والتي ينجم عنها ثقباً أصغر بكثيرٍ في قطره: وهو ما يُعْرَفُ باسم ثقب النانو. مما يجعل من الضروري توضيح طريقة تعامل النظرية القائمة وراء سلسلة ثقب النانو لما يحدث في حالة انغماس ثقب النانو في سائلٍ موصلٍ وانتشار جهد التيار عبره: حيث يمكن ملاحظة تحت تلك الظروف مرور تيارٍ كهربائيٍ خفيفٍ بسبب توصيل الأيونات عبر ثقب النانو، كما أن كمية التيار تُعَدُ حساسةٌ جداً لحجم وشكل ثقب النانو. فلو مرت نوكليوتيداتٍ (قواعدٍ) فرديةٍ أو خيوط الحمض الريبي النووي عبر ثقبٍ للنانو، فقد يؤدي هذا إلى تغيير السمات في مقدار التيار عبر ثقب النانو هذا. ويمكن تمرير الحمض الريبي النووي عبر ثقب النانو للعديد من الأسباب، والتي منها على سبيل المثال أن عملية الرحلان الكهربائي (الهجرة الكهربائية) قد تجتذب الحمض النووي صوب ثقب النانو، كما أنه قد يمر في نهاية المطاف من خلاله. أو أن الإنزيمات المتصلة بثقب النانو قد ترشد وتوجه الحمض النووي صوب ثقب النانو. هذا ويعني مقياس ثقب النانو أن الحمض النووي قد يكون ملزماً للمرور عبر الثقب كخيطٍ طويلٍ، قاعدةً واحدةً (نوكليوتيد) في كل مرةٍ، وليس كمثل مرور الخيط عبر عين الإبرة. وبوقوع مثل ذلك الأمر، قد يُعيق أو يُعرقل كل نوكليوتيد على جزيء الحمض النووي ثقب النانو بدرجةٍ مختلفةٍ متميزةٍ. مما يجعل كمية أو مقدار التيار التي تمر عبر ثقب النانو متغيرةً في أية لحظةٍ بُناءً على ما إذا كان ثقب النانو قد تم إعاقته وحجبه بواسطة A، C، G أو T. ويوفر التغير في التيار المار عبر ثقب النانو، مع مرور جزيء الحمض النووي الريبي عبر ثقب النانو، قراءةً مباشرةً لسلسلة الحمض النووي. وبدلاً من ذلك، فقد يُسْتَخْدَمُ ثقب النانو لتحديد قواعد الحمض الريبي النووي الفردية مع مرورها عبر ثقب النانو في الترتيب الصحيح – حيث أوضح البروفيسور هاغان بارلي وشركة أكسفورد لتقنيات ثقب النانو ذلك المدخل البحثي الجديد. ويتمثل الجهد في أنه يمكن تسلسل جزيءٍ واحدٍ مفردٍ من الحمض الريبي النووي مباشرةً باستخدام ثقب النانو، وذلك بدون الحاجة إلى خطوة تضخيم تفاعل البوليميراز المتسلسل التدخلي أو خطوة الترميز الكيميائي أو حتى الحاجة إلى استخدام الأجهزة البصرية لتحديد المسمى الكيميائي. ما زالت، حتى يوليو 2010، المعلومات المتوفرة أمام العامة تشير إلى أن ثقب النانو ما زال في طور التطوير والتنمية، مع توفر بعض البيانات المختبرية لدعم المكونات المختلفة لطريقة التسلسل، إلا أنها ما زالت غير متاحةٍ بعد للاستخدامات التجارية، أو متوازيةٍ أو حتى اقتصاديةٍ التكلفة بصورةٍ كافيةٍ للتنافس مع طرق «سلسلة الجيل القادم» والتي تم الإعلان عنها. وكانت شركات كلٍ من تقنيات أكسفورد لثقوب النانو (بالإنجليزية: Oxford Nanopore Technologies) (من خلال تطوير سلسلة النيكليز الخارجي المباشر وسلسلة ضفيرة الحمض النووي باستخدام ثقوب البروتين النانوية، بالإضافة إلى سلسلة المواد الصلبة عبر عملية R&D الداخلية والتعاون المشترك مع المعاهد الأكاديمية المتخصصة)، وشركة NabSys (باستخدام مكتبة مسابير الحمض الريبي النووي وباستخدام ثقوب النانو لاكتشاف الأماكن التي تم تهجين تلك المسابير بها لتصبح ضفيرةٍ مفردةٍ للحمض الريبي النووي) بالإضافة إلى شركة NobleGen (من خلال استخدام ثقوب النانو مع رقع النيون (بالإنجليزية: fluorescent label)) قد قاموا بتطوير أساليب تحليل الحمض النووي القائمة على ثقب النانو صناعياً. في حين قامت شركة آي بي إم بملاحظة المشاريع البحثية على صور محاكاة الحاسوب للانتقال المكاني لضفيرة الحمض الريبي النووي عبر ثقب النانو الصلب، ولكن ليس تلك المشروعات القائمة على تحديد قواعد الحمض الريبي النووي على تلك الضفيرة. إلا أن أحد التحديات التي تواجه طريقة «'تسلسل الضفيرة '» يتمثل في تنقية الطريقة لتحسين ثباتها لتصبح قادرةً على اكتشاف القواعد الفردية. وفي طرائف الأبحاث الأولى، كانت هناك حاجةٌ إلى تكرار النوكليوتيد نحو 100 مرةٍ بنجاحٍ في سلسلةٍ، وذلك بهدف إحداث تغيراً مميزٍ يمكن قياسه. إلا أن الثبات المنخفض هذا يرجع إلى حقيقة أن ضفيرة الحمض النووي تتحرك سريعاً بمعدلٍ يتراوح من 1 إلى 5 ميكروثانيةً لكل قاعدةٍ عبر ثقب النانو. مما جعل عملية التسجيل صعبة ومنصبة على الضوضاء الخلفية، مما جعلها تفشل في تحقيق ثبات النوكليوتيد المفرد. إلا أنه تم مواجهة تلك المشكلة إما من خلال تحسين تقنية التسجيل أو بواسطة ضبط سرعة ضفيرة الحمض النووي بواسطة العديد من خطط هندسة البروتين. هذا وقد تم مؤخراً توضيح تأثيرات القواعد الفردية بسبب البنية الثانوية أو النوكليوتيدات الأحادية المنبعثة (المنطلقة). كما افترض البروفيسور هاغان باي لاي، مؤسس شركة أوكسفورد لثقوب النانو، مؤخراً أن إنشاء موقعين للتمييز والإدراك داخل ثقب ألفا هيمولوسين (بالإنجليزية: alpha hemolysin pore) قد يسمح بتداول المزايا في تمييز القاعدة. في حين تتمثل إحدى تحديات «منهجية النيوكليس الخارجي»، حيث يُغَذِّي الإنزيم العلاجي القواعد الفردية، في الترتيب الصحيح، وداخل ثقب النانو، في دمج أنظمة النيوكليس الخارجي واكتشاف ثقب النانو. وعلى الأخص، تتمثل المشكلة في أنه عندما يُحَلميء (يسكر الرابطة الكيميائية) النيوكليس الخارجي روابط phosphodieseter بين النوكليوتيدات في الحمض النووي، فليس من الضروري أن يتم اعتماد النوكليوتيد المنطلق ليتحرك مباشرةً صوب ثقب alpha-hemolysin النانوي. وأحد الأفكار تتمثل في أن يتم توصيل النيوكليس الخارجي بثقب النانو، والذي قد يحدث عبر Biotinylation إلى إنزيم الحالة الدموية (هيموليسين) بيتا بارل (بالإنجليزية: beta barrel hemolsyin). فقد يصطف الثقب الفردي للبروتين مع الرواسب المتغيرة المرتبة ومن ثم تظهر الشحنات الموجبة والسالبة على الجوانب المتقابلة للثقب. على الرغم من ذلك، تُعَدُ تلك الآلية مميزةٍ مبدئياً ولا تشكل آليةً لإرشاد وتوجيه النوكليوتيدات في دربها الخاص.
rdf:langString
La secuenciación por nanoporos es un método para determinar el orden en el que los nucleótidos se organizan en una hebra de ADN. Este método está en desarrollo desde 1995. Es un método de análisis simple y directo de ADN que hará que las pruebas genéticas sean cada vez más habituales. Consiste en generar nanoporos entre dos compartimientos y a través de la observación de los cambios en la corriente eléctrica dentro del nanoporo debida a los iones que pasan de un compartimiento al otro, identificar los nucleótidos que pasan dentro del mismo. Un nanoporo es un pequeño agujero del orden de 1 nanómetro en su diámetro interno, se pueden crear por una proteína formadora de poros o como un agujero en materiales sintéticos como silicona o grafeno. Cuando un nanoporo se inserta en un y se le proporciona un voltaje, se puede observar una corriente eléctrica producida por la conducción de iones a través del nanoporo. La cantidad de la corriente observada es sensible a la forma y el tamaño del nanoporo. Si pasa una base, una hebra entera de ADN u otra molécula por el nanoporo, la magnitud de la corriente varía.
rdf:langString
Nanopore sequencing is a third generation approach used in the sequencing of biopolymers — specifically, polynucleotides in the form of DNA or RNA. Using nanopore sequencing, a single molecule of DNA or RNA can be sequenced without the need for PCR amplification or chemical labeling of the sample. Nanopore sequencing has the potential to offer relatively low-cost genotyping, high mobility for testing, and rapid processing of samples with the ability to display results in real-time. Publications on the method outline its use in rapid identification of viral pathogens, monitoring ebola, environmental monitoring, food safety monitoring, human genome sequencing, plant genome sequencing, monitoring of antibiotic resistance, haplotyping and other applications.
rdf:langString
Sekuensing nanopore adalah pendekatan generasi ketiga yang digunakan dalam proses sekuensing biopolimer - khususnya polinukleotida dalam bentuk DNA atau RNA. Dengan melakukan sekuensing nanpore, molekul DNA atau RNA tunggal dapat disekuensi tanpa memerlukan amplifikasi PCR atau pelabelan kimia pada sampel. Paling tidak salah satu langkah ini diperlukan dalam prosedur sekuensing yang telah dikembangkan sebelumnya. Sekuensing nanopore memiliki potensi sebagai metode yang relatif murah, memiliki mobilitas yang tinggi dalam proses pengujian, serta memiliki waktu pemrosesan yang cepat. Publikasi mengenai metode sekuensing nanopore menjabarkan kegunaannya dalam identifikasi patogen virus secara cepat, pengawasan ebola, pengawasan lingkungan, pengawasan ketahanan pangan, sekuensing genom manusia, sekuensing genom tumbuhan, pengawasan kekebalan terhadap antibiotik, haplotiping dan kegunaan-kegunaan lainnya.
rdf:langString
Le séquençage de l'ADN par les nanopores est une méthode utilisée depuis 1995. Elle permet de déterminer l'ordre dans lequel les nucléotides sont disposés sur un fragment d'ADN donné à l'aide de nanopores (trou avec un diamètre de l'ordre du nanomètre). Des protéines cellulaires transmembranaires possédant des petits pores peuvent agir comme des nanopores. Des nanopores peuvent également être construits dans un résidu de silicium simplement en y effectuant un trou d'une dizaine de nanomètres. Le morceau de silicium est par la suite rempli lentement par à l'aide de . Le graphène peut également être utilisé comme substrat synthétique pour les nanopores semi-conducteurs.
rdf:langString
Нанопо́ровое секвени́рование — семейство высокоэффективных методов секвенирования ДНК или РНК третьего поколения. Метод основан на использовании белковых, твердотельных или иных пор диаметром в несколько нанометров, чувствительных к нуклеиновым кислотам. Нанопоровое секвенирование позволяет избежать стадий ПЦР-амплификации и химического мечения образца ДНК или РНК. Это является существенным преимуществом по сравнению с другими методами секвенирования, которые используют хотя бы одну из этих стадий. Возможности метода включают относительно дешёвое генотипирование, высокую мобильность, быстрый анализ и отображение результатов в реальном времени. Было описано использование метода в быстром выявлении вирусных патогенов, отслеживании бактериальной резистентности, секвенировании генома человека и растений, гаплотипировании, отслеживании вируса эболы и других областях.
rdf:langString
奈米孔定序（英語：Nanopore sequencing），又稱奈米孔定序，是一種針對核酸（RNA與DNA）進行测序的第三代定序技術。奈米孔定序技術不同於過去的基因定序技術，無須對樣品進行聚合酶链式反应或化學標記即可對一條DNA或RNA分子進行定序。奈米孔定序可以相對低廉的成本對個體進行基因型分型成本相對低廉，並具可攜帶性高、樣品處理的過程簡易快速與可以即時分析結果等優點。目前奈米孔定序已被廣泛應用在各種領域，如病原體的快速檢測、監測伊波拉病毒爆發的情況、環境微生物監測、食品安全監控、人類基因體定序、植物基因體定序、抗生素抗藥性檢測 、單倍型分析及其他相關應用。
xsd:nonNegativeInteger
38119
