Multiplex polymerase chain reaction
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マルチプレックスPCR(マルチプレックスポリメラーゼ連鎖反応、Multiplex PCR)はポリメラーゼ連鎖反応の変法で、長大な遺伝子の中から欠失や重複を検出するのに用いられる。マルチプレックスPCRではゲノムDNAサンプルを、サーマルサイクラー中で複数のプライマーとDNAポリメラーゼで増幅する。マルチプレックスPCRは最初、1988年にジストロフィン遺伝子の欠失を検出する方法として発表されたほか、遺伝子にも用いられた。2008年には、マルチプレックスPCRはマイクロサテライトや一塩基多型(SNP)の検出にも用いられた。 マルチプレックスPCRでは、異なる配列を持つ様々なゲノム領域を増幅するため、1つのPCR試薬ミックスに複数のプライマーセットが含まれている。一度に複数のゲノム領域を増幅対象とすることで、それぞれの配列情報を1回のPCR実験で得ることができ、試薬と時間を節約することが可能となる。各プライマーセットのアニーリング温度は1反応でばらつきが生じないように最適化する必要がある。また、アンプリコンのサイズ(増幅するゲノム領域の鎖長)は通常、ゲル電気泳動で可視化した際に差が出るよう、互いに異なっている必要がある。マルチプレックスPCRキットは市販されており、法医学における劣化DNAサンプルや臨床検査におけるHLA、CYP等の解析など、様々な用途に用いられている。
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多重聚合酶链式反应(英語:Multiplex Polymerase Chain Reaction, Multiplex PCR)是指利用聚合酶链式反应同时扩增几个不同的DNA序列(就像在一个反应中执行许多单独的聚合酶链式反应一样)。该过程使用多个引物和热循环仪中的温度介导的DNA聚合酶扩增样品中的DNA。必须优化所有引物对的引物设计,以便所有引物对可以在PCR期间在相同的退火温度下工作。 1988年,多重PCR首次被作为一种检测肌营养不良蛋白基因缺失的方法出现。它也已与甾族硫酸酯酶基因一起使用。 2008年,多重PCR技术用于分析微卫星和SNP。 多重PCR由单一PCR混合物中的多个引物组组成,以产生对不同DNA序列特异的大小不同的。通过一次靶向多个序列,可以从一次测试运行中获得其他信息,否则将需要数倍的试剂和更多的时间来执行。每个引物组的退火温度必须经过优化,以在单个反应中正确地起作用,并且当通过凝胶电泳观察时,扩增子的大小(即其碱基对长度)应有足够的不同,来形成不同的条带。如果扩增子大小重叠,则可选地可以使用已经用不同颜色的荧光染料染色的引物来区分和可视化不同的扩增子。市面上已有用于PCR的商业多路复用试剂盒,并被许多法医实验室用来扩增降解的DNA样品。
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Die Multiplex-PCR ist eine Anwendungsform der diagnostischen PCR. Ursprünglich wurde die PCR vor allem für die Amplifizierung (Vervielfältigung) von DNA zur Sequenzierung (Bestimmung der Basenabfolge) der amplifizierten DNA eingesetzt. Durch den Fortschritt der Sequenzierungsprojekte wurde es möglich, die PCR als diagnostische Methode zu benutzen. Mit der Kenntnis der Basenabfolge im Genom eines Organismus wurde es möglich, die für diesen Organismus spezifischen Sequenzen oder die mit einer Krankheit verbundenen Sequenzveränderungen zu ermitteln. Auf diese spezifischen Sequenzen wird dann eine diagnostische PCR entwickelt. Eine solche PCR zum Nachweis eines Abschnitts im Genom wird auch als Singleplex-PCR oder Einzel-PCR bezeichnet. Für viele Erkrankungen können aber verschiedene Viren ode
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Una PCR múltiple refiere al uso de reacción de cadena de la polimerasa para amplificar varias secuencias de ADN diferentes simultáneamente (como si se realizaran muchas reacciones de PCR separadas todas juntas en una sola reacción). Este proceso amplifica ADN en las muestras que utilizan múltiples primers y una ADN polimerasa mediada por temperatura en un termocilador. El diseño de cada par de primers tiene que ser optimizado de modo que todos puedan trabajar a la misma temperatura de hibridación durante la PCR.
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Multiplex polymerase chain reaction (Multiplex PCR) refers to the use of polymerase chain reaction to amplify several different DNA sequences simultaneously (as if performing many separate PCR reactions all together in one reaction). This process amplifies DNA in samples using multiple primers and a temperature-mediated DNA polymerase in a thermal cycler. The primer design for all primers pairs has to be optimized so that all primer pairs can work at the same annealing temperature during PCR.
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La reazione a catena della polimerasi Multiplex (PCR Multiplex) è una modifica della normale PCR per individuare rapidamente delezioni o duplicazioni in un grande gene. Questo processo amplifica i campioni di DNA genomico utilizzando più primer e una DNA polimerasi con efficienza direttamente collegata alla temperatura all'interno di un termociclatore. La PCR Multiplex è stata descritta nel 1988 come metodo per rilevare alcune delezioni nel gene distrofina. È stato anche utilizzato con il gene della . Nel 2008 è stata utilizzata per l'analisi dei microsatelliti e SNPs.
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Multiplex-PCR
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PCR múltiple
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Multiplex PCR
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Multiplex polymerase chain reaction
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マルチプレックスPCR
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多重聚合酶鏈式反應
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Die Multiplex-PCR ist eine Anwendungsform der diagnostischen PCR. Ursprünglich wurde die PCR vor allem für die Amplifizierung (Vervielfältigung) von DNA zur Sequenzierung (Bestimmung der Basenabfolge) der amplifizierten DNA eingesetzt. Durch den Fortschritt der Sequenzierungsprojekte wurde es möglich, die PCR als diagnostische Methode zu benutzen. Mit der Kenntnis der Basenabfolge im Genom eines Organismus wurde es möglich, die für diesen Organismus spezifischen Sequenzen oder die mit einer Krankheit verbundenen Sequenzveränderungen zu ermitteln. Auf diese spezifischen Sequenzen wird dann eine diagnostische PCR entwickelt. Eine solche PCR zum Nachweis eines Abschnitts im Genom wird auch als Singleplex-PCR oder Einzel-PCR bezeichnet. Für viele Erkrankungen können aber verschiedene Viren oder Bakterien oder genomische Veränderungen die Ursache sein. Deshalb ist es zur Bestimmung der Ursache der Erkrankung notwendig, mehrere Singleplex-PCR-Nachweise durchzuführen. Unter diesen Bedingungen ist eine Multiplex-PCR sinnvoll.
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Una PCR múltiple refiere al uso de reacción de cadena de la polimerasa para amplificar varias secuencias de ADN diferentes simultáneamente (como si se realizaran muchas reacciones de PCR separadas todas juntas en una sola reacción). Este proceso amplifica ADN en las muestras que utilizan múltiples primers y una ADN polimerasa mediada por temperatura en un termocilador. El diseño de cada par de primers tiene que ser optimizado de modo que todos puedan trabajar a la misma temperatura de hibridación durante la PCR. La PCR múltiple fue descrita por primera vez en 1988 como un método para detectar deleciones en el gen de la distrofina. También ha sido utilizada con el gen de la esteroide sulfatasa. En 2008, se empleó PCR múltiplee para el análisis de microsatellites y SNPs. En 2020, se diseñaron ensayos de RT-PCR combinando múltiples genes diana del Centro para el Control y Prevención de Enfermedades en una sola reacción para aumentar la accesibilidad y el rendimiento del diagnóstico del SARS-CoV-2. La PCR múltiple consta de múltiples pares de primers dentro de una sola mezcla de PCR para producir amplicones de varias longitudes que son específicas de diferentes secuencias de ADN. Annealing Temperaturas para cada del primer los conjuntos tienen que ser optimizados para trabajar correctamente dentro de una reacción sola, y amplicon medidas, i.e., su longitud de par de la base, tendría que ser bastante diferente para formar las bandas distintas cuándo visualizadas por electroforesis en gel. Alternativamente, si coinciden las longitudes de algunos amplicones, éstos pueden diferenciarse y visualizarse mediante primers teñidos con distintas sondas fluorescentes.
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Multiplex polymerase chain reaction (Multiplex PCR) refers to the use of polymerase chain reaction to amplify several different DNA sequences simultaneously (as if performing many separate PCR reactions all together in one reaction). This process amplifies DNA in samples using multiple primers and a temperature-mediated DNA polymerase in a thermal cycler. The primer design for all primers pairs has to be optimized so that all primer pairs can work at the same annealing temperature during PCR. Multiplex-PCR was first described in 1988 as a method to detect deletions in the dystrophin gene. It has also been used with the steroid sulfatase gene. In 2008, multiplex-PCR was used for analysis of microsatellites and SNPs. In 2020, RT-PCR multiplex assays were designed that combined multiple gene targets from the Center for Diseases and Control in a single reaction to increase molecular testing accessibility and throughput for SARS-CoV-2 diagnostics. Multiplex-PCR consists of multiple primer sets within a single PCR mixture to produce amplicons of varying sizes that are specific to different DNA sequences. By targeting multiple sequences at once, additional information may be gained from a single test run that otherwise would require several times the reagents and more time to perform. Annealing temperatures for each of the primer sets must be optimized to work correctly within a single reaction, and amplicon sizes, i.e., their base pair length, should be different enough to form distinct bands when visualized by gel electrophoresis. Alternatively, if amplicon sizes overlap, the different amplicons may be differentiated and visualised using primers that have been dyed with different colour fluorescent dyes. Commercial multiplexing kits for PCR are available and used by many forensic laboratories to amplify degraded DNA samples.
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La reazione a catena della polimerasi Multiplex (PCR Multiplex) è una modifica della normale PCR per individuare rapidamente delezioni o duplicazioni in un grande gene. Questo processo amplifica i campioni di DNA genomico utilizzando più primer e una DNA polimerasi con efficienza direttamente collegata alla temperatura all'interno di un termociclatore. La PCR Multiplex è stata descritta nel 1988 come metodo per rilevare alcune delezioni nel gene distrofina. È stato anche utilizzato con il gene della . Nel 2008 è stata utilizzata per l'analisi dei microsatelliti e SNPs. La PCR Multiplex è costituita da più set di primer in un unico mix PCR per produrre di varie dimensioni che sono specifici per diverse sequenze di DNA target. Prendendo di mira molti geni in un solo ciclo di PCR, le informazioni necessarie possono essere acquisite da una singolo test che altrimenti richiederebbe l'uso di più reagenti e più tempo per l'esecuzione. Temperature di "annealing" per ciascun set di primer devono essere ottimizzate per operare correttamente in un'unica reazione. Sono disponibili kit per effettuare la PCR multiplex, utilizzati da molti laboratori di polizia scientifica per amplificare campioni di DNA degradati.
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マルチプレックスPCR(マルチプレックスポリメラーゼ連鎖反応、Multiplex PCR)はポリメラーゼ連鎖反応の変法で、長大な遺伝子の中から欠失や重複を検出するのに用いられる。マルチプレックスPCRではゲノムDNAサンプルを、サーマルサイクラー中で複数のプライマーとDNAポリメラーゼで増幅する。マルチプレックスPCRは最初、1988年にジストロフィン遺伝子の欠失を検出する方法として発表されたほか、遺伝子にも用いられた。2008年には、マルチプレックスPCRはマイクロサテライトや一塩基多型(SNP)の検出にも用いられた。 マルチプレックスPCRでは、異なる配列を持つ様々なゲノム領域を増幅するため、1つのPCR試薬ミックスに複数のプライマーセットが含まれている。一度に複数のゲノム領域を増幅対象とすることで、それぞれの配列情報を1回のPCR実験で得ることができ、試薬と時間を節約することが可能となる。各プライマーセットのアニーリング温度は1反応でばらつきが生じないように最適化する必要がある。また、アンプリコンのサイズ(増幅するゲノム領域の鎖長)は通常、ゲル電気泳動で可視化した際に差が出るよう、互いに異なっている必要がある。マルチプレックスPCRキットは市販されており、法医学における劣化DNAサンプルや臨床検査におけるHLA、CYP等の解析など、様々な用途に用いられている。
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多重聚合酶链式反应(英語:Multiplex Polymerase Chain Reaction, Multiplex PCR)是指利用聚合酶链式反应同时扩增几个不同的DNA序列(就像在一个反应中执行许多单独的聚合酶链式反应一样)。该过程使用多个引物和热循环仪中的温度介导的DNA聚合酶扩增样品中的DNA。必须优化所有引物对的引物设计,以便所有引物对可以在PCR期间在相同的退火温度下工作。 1988年,多重PCR首次被作为一种检测肌营养不良蛋白基因缺失的方法出现。它也已与甾族硫酸酯酶基因一起使用。 2008年,多重PCR技术用于分析微卫星和SNP。 多重PCR由单一PCR混合物中的多个引物组组成,以产生对不同DNA序列特异的大小不同的。通过一次靶向多个序列,可以从一次测试运行中获得其他信息,否则将需要数倍的试剂和更多的时间来执行。每个引物组的退火温度必须经过优化,以在单个反应中正确地起作用,并且当通过凝胶电泳观察时,扩增子的大小(即其碱基对长度)应有足够的不同,来形成不同的条带。如果扩增子大小重叠,则可选地可以使用已经用不同颜色的荧光染料染色的引物来区分和可视化不同的扩增子。市面上已有用于PCR的商业多路复用试剂盒,并被许多法医实验室用来扩增降解的DNA样品。
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