Ku (protein)

http://dbpedia.org/resource/Ku_(protein) an entity of type: Thing

Białko Ku – heterodimer białka Ku70 (masa 69 kDa) i Ku86 (masa 83 kDA, zwane również Ku80), będący ważnym czynnikiem łączącym końce nici DNA w procesie niehomologicznego scalania końców DNA.U wielu organizmów, białko Ku pełni dodatkowe funkcje w telomerach, inne niż naprawa DNA. rdf:langString

Ku es una proteína que se une a terminaciones quebradas de ADN de doble hebra y es necesaria para la ruta de reparación del ADN por recombinación no homóloga (NHEJ). Ku se encuentra evolutivamente conservada desde las bacterias hasta los humanos. La proteína Ku ancestral conservada en bacterias es una homodímero (dos copias de la misma proteína unidas entre sí). Las Ku eucarióticas son un heterodímero de dos polipéptidos, Ku70 y Ku80, llamada así porque el peso molecular de las proteínas Ku humanas es de alrededor de 70 kDa y 80 kDa. Las dos subunidades Ku forman una estructura similar a una canasta que se une al extremo del ADN. Una vez unidos, Ku pueden deslizarse hacia abajo en la hebra de ADN, lo que permite a otras moléculas de Ku unirse al extremo libre. En eucariotas superiores, K rdf:langString

Ku is a dimeric protein complex that binds to DNA double-strand break ends and is required for the non-homologous end joining (NHEJ) pathway of DNA repair. Ku is evolutionarily conserved from bacteria to humans. The ancestral bacterial Ku is a homodimer (two copies of the same protein bound to each other). Eukaryotic Ku is a heterodimer of two polypeptides, Ku70 (XRCC6) and Ku80 (XRCC5), so named because the molecular weight of the human Ku proteins is around 70 kDa and 80 kDa. The two Ku subunits form a basket-shaped structure that threads onto the DNA end. Once bound, Ku can slide down the DNA strand, allowing more Ku molecules to thread onto the end. In higher eukaryotes, Ku forms a complex with the DNA-dependent protein kinase catalytic subunit (DNA-PKcs) to form the full DNA-dependent rdf:langString

Ku自己抗原（Ku autoantigen、しばしば「Ku」とのみ表記される）は、DNA二本鎖切断末端に結合する二量体タンパク質複合体であり、DNA修復の非相同末端結合（NHEJ）経路に必須の生体分子である。 Kuは細菌から人間まで広範囲の生物に進化的に保存されている。祖先の細菌Kuはホモ二量体である。真核生物のKuは、Ku70 （XRCC6）とKu80 （XRCC5）という2つのポリペプチドのヘテロ二量体であり、それらの名称の由来はヒトKuサブユニットの分子量がそれぞれ約70kDaと80kDaであるためである。2つのKuサブユニットはどちらも、DNA末端を通すバスケット型の構造を形成している。これらが会合すると、KuはDNA鎖を滑り、より多くのKu分子が末端を通ることができるようにする。高等真核生物では、KuはDNA依存性プロテインキナーゼ触媒サブユニット（DNA-PKcs）と複合体を形成し、完全なDNA依存性プロテインキナーゼであるDNA-PKを形成する。Kuは、NHEJに関与する他のタンパク質が結合できる足場分子として機能し、核酸連結のために二本鎖切断に方向性を与えると考えられている。 Kuの両方のサブユニットについて、マウスで遺伝子をノックアウトする実験が行わている。これらのマウスでは染色体の不安定性が示され、Ku並びにNHEJがゲノムの維持に重要であることを明らかにした。 rdf:langString

Ku — белок, связывающийся с двуцепочечными разрывами в структуре ДНК. Ku необходим для репарации ДНК по пути негомологичного соединения концов (NHEJ). Эволюционно Ku консервативен от бактерий до человека. Древний бактериальный Ku является гомодимером, эукариотический гомолог Ku — гетеродимер, состоящий из двух полипептидов — Ku70 (продукт гена XRCC6) и Ku80 (закодирован геном XRCC5), молекулярная масса этих полипептидов составляет 70 и 80 кДа, соответственно. Субъединицы Ku образуют корзиноподобную структуру, закрепляющуюся на конце молекулы ДНК. После связывания Ku может скользить по цепочке ДНК, на конец которой могут нанизываться новые молекулы Ku. У высших эукариот Ku образует комплекс с каталитической субъединицей ДНК-зависимой протеинкиназы (DNA-PKcs) и образует полную ДНК-зависимую rdf:langString

rdfs:label

rdf:langString Ku (proteína)

rdf:langString Ku (protein)

rdf:langString Ku自己抗原

rdf:langString Ku (białko)

rdf:langString Ku

foaf:name

rdf:langString X-ray repair

rdf:langString cross-complementing 5

rdf:langString cross-complementing 6

dbpprop:name

rdf:langString Ku C terminal domain like

rdf:langString Ku70/Ku80 C-terminal arm

rdf:langString Ku70/Ku80 N-terminal alpha/beta domain

rdf:langString Ku70/Ku80 beta-barrel domain

rdf:langString X-ray repair

rdf:langString cross-complementing 5

rdf:langString cross-complementing 6

dbpedia-owl:wikiPageID

xsd:integer 5058843

dbpedia-owl:wikiPageRevisionID

xsd:integer 1122811779

dbpprop:omim

xsd:integer 152690 194364

dbpprop:prosite

rdf:langString PDOC00252

dbpprop:scop

xsd:integer 1

dbpprop:altsymbols

rdf:langString Ku80

rdf:langString Ku70, G22P1

dbpprop:caption

<second> 259200.0

rdf:langString crystal structure of the ku heterodimer bound to dna

rdf:langString crystal structure of the ku heterodimer

rdf:langString Crystal structure of human Ku bound to DNA. Ku70 is shown in purple, Ku80 in blue, and the DNA strand in green.

dbpprop:interpro

rdf:langString IPR005160

rdf:langString IPR005161

rdf:langString IPR006164

rdf:langString IPR014893

dbpprop:pfam

rdf:langString PF02735

rdf:langString PF03730

rdf:langString PF03731

rdf:langString PF08785

dbpprop:pfamClan

rdf:langString CL0128

dbpprop:symbol

rdf:langString Ku

rdf:langString Ku_C

rdf:langString Ku_N

rdf:langString Ku_PK_bind

dbpprop:uniprot

rdf:langString P12956

rdf:langString P13010

dbpedia-owl:abstract

rdf:langString Ku es una proteína que se une a terminaciones quebradas de ADN de doble hebra y es necesaria para la ruta de reparación del ADN por recombinación no homóloga (NHEJ). Ku se encuentra evolutivamente conservada desde las bacterias hasta los humanos. La proteína Ku ancestral conservada en bacterias es una homodímero (dos copias de la misma proteína unidas entre sí). Las Ku eucarióticas son un heterodímero de dos polipéptidos, Ku70 y Ku80, llamada así porque el peso molecular de las proteínas Ku humanas es de alrededor de 70 kDa y 80 kDa. Las dos subunidades Ku forman una estructura similar a una canasta que se une al extremo del ADN. Una vez unidos, Ku pueden deslizarse hacia abajo en la hebra de ADN, lo que permite a otras moléculas de Ku unirse al extremo libre. En eucariotas superiores, Ku forma un complejo con la subunidad catalítica de las proteínas quinasa dependiente de ADN (ADN-PKcs) para formar la quinasa dependiente de ADN (ADN-PK).Se cree que Ku funciona como un andamio molecular al cual otras proteínas que participan en NHEJ pueden unirse.Ambas subunidades del Ku han sido experimentadas en ratones knock out. Estos ratones muestran inestabilidad cromosómica, lo que indica que NHEJ es importante para el mantenimiento del genoma. En muchos organismos, Ku tiene funciones adicionales en los telómeros, además de su papel en la reparación del ADN.

rdf:langString Ku is a dimeric protein complex that binds to DNA double-strand break ends and is required for the non-homologous end joining (NHEJ) pathway of DNA repair. Ku is evolutionarily conserved from bacteria to humans. The ancestral bacterial Ku is a homodimer (two copies of the same protein bound to each other). Eukaryotic Ku is a heterodimer of two polypeptides, Ku70 (XRCC6) and Ku80 (XRCC5), so named because the molecular weight of the human Ku proteins is around 70 kDa and 80 kDa. The two Ku subunits form a basket-shaped structure that threads onto the DNA end. Once bound, Ku can slide down the DNA strand, allowing more Ku molecules to thread onto the end. In higher eukaryotes, Ku forms a complex with the DNA-dependent protein kinase catalytic subunit (DNA-PKcs) to form the full DNA-dependent protein kinase, DNA-PK. Ku is thought to function as a molecular scaffold to which other proteins involved in NHEJ can bind, orienting the double-strand break for ligation. The Ku70 and Ku80 proteins consist of three structural domains. The N-terminal domain is an alpha/beta domain. This domain only makes a small contribution to the dimer interface. The domain comprises a six-stranded beta sheet of the Rossmann fold. The central domain of Ku70 and Ku80 is a DNA-binding beta-barrel domain. Ku makes only a few contacts with the sugar-phosphate backbone, and none with the DNA bases, but it fits sterically to major and minor groove contours forming a ring that encircles duplex DNA, cradling two full turns of the DNA molecule. By forming a bridge between the broken DNA ends, Ku acts to structurally support and align the DNA ends, to protect them from degradation, and to prevent promiscuous binding to unbroken DNA. Ku effectively aligns the DNA, while still allowing access of polymerases, nucleases and ligases to the broken DNA ends to promote end joining. The C-terminal arm is an alpha helical region which embraces the central beta-barrel domain of the opposite subunit. In some cases a fourth domain is present at the C-terminus, which binds to DNA-dependent protein kinase catalytic subunit. Both subunits of Ku have been experimentally knocked out in mice. These mice exhibit chromosomal instability, indicating that NHEJ is important for genome maintenance. In many organisms, Ku has additional functions at telomeres in addition to its role in DNA repair. Abundance of Ku80 seems to be related to species longevity.

rdf:langString Ku自己抗原（Ku autoantigen、しばしば「Ku」とのみ表記される）は、DNA二本鎖切断末端に結合する二量体タンパク質複合体であり、DNA修復の非相同末端結合（NHEJ）経路に必須の生体分子である。 Kuは細菌から人間まで広範囲の生物に進化的に保存されている。祖先の細菌Kuはホモ二量体である。真核生物のKuは、Ku70 （XRCC6）とKu80 （XRCC5）という2つのポリペプチドのヘテロ二量体であり、それらの名称の由来はヒトKuサブユニットの分子量がそれぞれ約70kDaと80kDaであるためである。2つのKuサブユニットはどちらも、DNA末端を通すバスケット型の構造を形成している。これらが会合すると、KuはDNA鎖を滑り、より多くのKu分子が末端を通ることができるようにする。高等真核生物では、KuはDNA依存性プロテインキナーゼ触媒サブユニット（DNA-PKcs）と複合体を形成し、完全なDNA依存性プロテインキナーゼであるDNA-PKを形成する。Kuは、NHEJに関与する他のタンパク質が結合できる足場分子として機能し、核酸連結のために二本鎖切断に方向性を与えると考えられている。 Ku70およびKu80タンパク質はどちらも、3つの構造ドメインで構成されている。 N末端ドメインはアルファ/ベータドメインであり、その構造にはロスマンフォールドの6本鎖Βシートが含まれる。このドメインは二量体の界面に小さな寄与を果たす。中央ドメインは、 DNA結合性ベータバレルドメインである。KuはDNAの糖リン酸骨格とわずかに接触するだけでDNA塩基とは接触しないが、二重らせんの主溝と副溝の輪郭に立体的に適合し、二重鎖DNAを囲む閉環を形成する。Kuは、切断された2つのDNA末端の間に架橋を形成することにより構造的に支持および配置させ、末端を分解から保護し、かつ末端による無事なDNA部分への無差別な化学攻撃を防ぐ。Kuは、DNAポリメラーゼ、ヌクレアーゼ、およびリガーゼが損傷DNA末端にアクセスできるようにしながら、DNAを効果的に配置させ、二つの末端間の結合を促進する。C末端アームは、他方のサブユニットの中央ドメインのΒバレルドメインを包含するΑヘリックス領域である。これら3つのドメインのほかに4番目のドメインがC末端に存在する場合もあり、DNA-PKcsに結合する。 Kuの両方のサブユニットについて、マウスで遺伝子をノックアウトする実験が行わている。これらのマウスでは染色体の不安定性が示され、Ku並びにNHEJがゲノムの維持に重要であることを明らかにした。多くの生物では、KuはDNA修復に加えて、テロメアにおいて役割を持つ。 Ku80の豊富さは、種の寿命の長さに関係しているという研究結果もある。

rdf:langString Białko Ku – heterodimer białka Ku70 (masa 69 kDa) i Ku86 (masa 83 kDA, zwane również Ku80), będący ważnym czynnikiem łączącym końce nici DNA w procesie niehomologicznego scalania końców DNA.U wielu organizmów, białko Ku pełni dodatkowe funkcje w telomerach, inne niż naprawa DNA.

rdf:langString Ku — белок, связывающийся с двуцепочечными разрывами в структуре ДНК. Ku необходим для репарации ДНК по пути негомологичного соединения концов (NHEJ). Эволюционно Ku консервативен от бактерий до человека. Древний бактериальный Ku является гомодимером, эукариотический гомолог Ku — гетеродимер, состоящий из двух полипептидов — Ku70 (продукт гена XRCC6) и Ku80 (закодирован геном XRCC5), молекулярная масса этих полипептидов составляет 70 и 80 кДа, соответственно. Субъединицы Ku образуют корзиноподобную структуру, закрепляющуюся на конце молекулы ДНК. После связывания Ku может скользить по цепочке ДНК, на конец которой могут нанизываться новые молекулы Ku. У высших эукариот Ku образует комплекс с каталитической субъединицей ДНК-зависимой протеинкиназы (DNA-PKcs) и образует полную ДНК-зависимую протеинкиназу, DNA-PK. Ku, по-видимому, функционирует как молекулярный остов, к которому прикрепляются другие белки, принимающие участие в процессе NHEJ. Обе субъединицы Ku были экспериментально удалены из генома мыши. Такие мыши имели различные хромосомные перестройки, что указывает на необходимость NHEJ для поддержания целостности генома. Во многих организмах Ku имеет дополнительные функции по поддержанию структуры теломер. Обилие Ku80 по-видимому, влияет на продолжительность жизни организмов.

dbpprop:arm

rdf:langString q

dbpprop:band

xsd:integer 11 35

dbpprop:chromosome

xsd:integer 2 22

dbpprop:entrezgene

xsd:integer 2547 7520

dbpprop:hgncid

xsd:integer 4055 12833

dbpprop:locussupplementarydata

rdf:langString -q13