Kinetic proofreading
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Kinetic proofreading (or kinetic amplification) is a mechanism for error correction in biochemical reactions, proposed independently by John Hopfield (1974) and Jacques Ninio (1975). Kinetic proofreading allows enzymes to discriminate between two possible reaction pathways leading to correct or incorrect products with an accuracy higher than what one would predict based on the difference in the activation energy between these two pathways.
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La correction cinétique (ou amplification cinétique) est un mécanisme permettant de diminuer le taux d'erreurs d'une réaction biochimique. Il a été proposé indépendamment par John Hopfield (1974) et Jacques Ninio (1975). Une correction cinétique permet aux enzymes de discriminer entre deux voies réactionnelles conduisant à des produits différents avec une précision plus élevée que ce que l'on pourrait prédire en se basant simplement sur la différence d'énergie d'activation entre ces deux voies.
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Correction cinétique
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Kinetic proofreading
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Kinetic proofreading (or kinetic amplification) is a mechanism for error correction in biochemical reactions, proposed independently by John Hopfield (1974) and Jacques Ninio (1975). Kinetic proofreading allows enzymes to discriminate between two possible reaction pathways leading to correct or incorrect products with an accuracy higher than what one would predict based on the difference in the activation energy between these two pathways. Increased specificity is obtained by introducing an irreversible step exiting the pathway, with reaction intermediates leading to incorrect products more likely to prematurely exit the pathway than reaction intermediates leading to the correct product. If the exit step is fast relative to the next step in the pathway, the specificity can be increased by a factor of up to the ratio between the two exit rate constants. (If the next step is fast relative to the exit step, specificity will not be increased because there will not be enough time for exit to occur.) This can be repeated more than once to increase specificity further.
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La correction cinétique (ou amplification cinétique) est un mécanisme permettant de diminuer le taux d'erreurs d'une réaction biochimique. Il a été proposé indépendamment par John Hopfield (1974) et Jacques Ninio (1975). Une correction cinétique permet aux enzymes de discriminer entre deux voies réactionnelles conduisant à des produits différents avec une précision plus élevée que ce que l'on pourrait prédire en se basant simplement sur la différence d'énergie d'activation entre ces deux voies. Une telle augmentation de la spécificité est obtenue par l'introduction d'une étape irréversible permettant de quitter la réaction. Si les intermédiaires de réaction conduisant à des produits incorrects sont davantage susceptibles de quitter prématurément la voie que ceux conduisant au produit correct. Si l'étape de sortie est rapide par rapport à la prochaine étape de la voie (laissant ainsi à la sortie une chance importante d'être réalisée), la spécificité peut ainsi être augmentée par un facteur allant jusqu'au rapport entre les deux taux de sortie des constantes. Plusieurs étapes d'une telle amplification peuvent être combinées afin d'obtenir des spécificités plus importantes encore.
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