Histone acetylation and deacetylation
http://dbpedia.org/resource/Histone_acetylation_and_deacetylation an entity of type: AnatomicalStructure
組蛋白乙醯化(Histone acetylation)為真核生物染色體上包裹DNA的組蛋白N端之離胺酸被乙醯化的轉譯後修飾,為細胞調控基因表現的一種機制。此反應一般由組蛋白乙醯轉移酶(HAT)催化,组蛋白脱乙酰酶(HDAC)則可催化其逆反應組蛋白脫乙醯化( Histone deacetylation),將組蛋白上的乙醯基水解移除。組蛋白乙醯化是為一種表觀遺傳修飾,乙醯基化會消除組蛋白離胺酸所帶的正電荷,使其與DNA(帶負電)的結合力降低,因此可將原本纏繞較緊密的染色體結構(異染色質)轉成較疏鬆的型態(真染色質),有利於轉錄的進行而提升基因表現;組蛋白脫乙醯化的功能則與之相反,可使染色體結構變得更緊密而降低基因表現。 組蛋白上不同位點的多種修飾(包括乙醯化、甲基化、磷酸化等)可能組合成組蛋白密碼,共同影響染色體結構,並與細胞中的其他蛋白結合以調控基因的轉錄,例如具有布罗莫结构域的蛋白(包括許多轉錄因子)可與被乙醯化的組蛋白結合 。組蛋白密碼與DNA甲基化皆為的一部份。 組蛋白乙醯化調控許多基因的表現,因此其調控異常與發炎性疾病、心血管疾病、和多種癌症相關。此外對菸酒和藥物的成癮機制可能也與其促進染色體特定區域的組蛋白乙醯化以影響基因表現有關。
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Histone acetylation and deacetylation are the processes by which the lysine residues within the N-terminal tail protruding from the histone core of the nucleosome are acetylated and deacetylated as part of gene regulation.
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Acetylacja i deacetylacja histonów – modyfikacja potranslacyjna histonów, w której reszty lizyny na końcu N wystające z rdzenia nukleosomu zostają acetylowane lub deacetylowane. Stanowi epigenetyczny mechanizm kontroli ekspresji genów. Ponadto mechanizmy acetylacji/deacetylacji występują również u wielu niehistonowych białek jak czynniki transkrypcyjne, wpływając na ekspresję genów i inne procesy komórkowe.
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Na acetilação e deacetilação de histona, as histonas são acetiladas e deacetiladas em resíduos de lisina na ramificação N-terminal como parte da regulação genética. Tipicamente, estas reações são catalisadas por enzimas com atividade "histona acetiltransferase" (HAT) ou "histona deacetilase" (HDAC ou HD). Diversas formas de HATs e HDs têm sido identificadas. Entre eles, CBP/p300 é provavelmente a mais importante, devido a poder interagir com numerosos reguladores de transcrição.
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Histone acetylation and deacetylation
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Acetylacja i deacetylacja histonów
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Acetilação e deacetilação de histona
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組蛋白乙醯化
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Histone acetylation and deacetylation are the processes by which the lysine residues within the N-terminal tail protruding from the histone core of the nucleosome are acetylated and deacetylated as part of gene regulation. Histone acetylation and deacetylation are essential parts of gene regulation. These reactions are typically catalysed by enzymes with "histone acetyltransferase" (HAT) or "histone deacetylase" (HDAC) activity. Acetylation is the process where an acetyl functional group is transferred from one molecule (in this case, acetyl coenzyme A) to another. Deacetylation is simply the reverse reaction where an acetyl group is removed from a molecule. Acetylated histones, octameric proteins that organize chromatin into nucleosomes, the basic structural unit of the chromosomes and ultimately higher order structures, represent a type of epigenetic marker within chromatin. Acetylation removes the positive charge on the histones, thereby decreasing the interaction of the N termini of histones with the negatively charged phosphate groups of DNA. As a consequence, the condensed chromatin is transformed into a more relaxed structure that is associated with greater levels of gene transcription. This relaxation can be reversed by deacetylation catalyzed by HDAC activity. Relaxed, transcriptionally active DNA is referred to as euchromatin. More condensed (tightly packed) DNA is referred to as heterochromatin. Condensation can be brought about by processes including deacetylation and methylation.
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Acetylacja i deacetylacja histonów – modyfikacja potranslacyjna histonów, w której reszty lizyny na końcu N wystające z rdzenia nukleosomu zostają acetylowane lub deacetylowane. Stanowi epigenetyczny mechanizm kontroli ekspresji genów. Ludzki genom zawarty jest w chromatynie, stanowiącej złożony kompleks makromolekularny o dynamicznej strukturze zbudowany z DNA, histonów i białek niehistonowych. Upakowanie chromatyny ściśle reguluje proces transkrypcji, a przez to ekspresję genów. Na jej upakowanie ma wpływ acetylacja histonów w nukleosomie. Acetylacja histonów związana jest z rozluźnieniem chromatyny (tworzeniem euchromatyny) i zwiększeniem poziomu ekspresji genów, podczas gdy antagonistyczna deacetylacja histonów powoduje ściślejsze upakowanie chromatyny (tworzenie heterochromatyny) i hamowanie transkrypcji. Równowaga między tymi stanami osiągana jest przez działanie (HATs) i (HDACs). Poza tym wpływają na nią (HDACis), które hamują działanie HDACs, zapobiegając deacetylacji. Acetylotransferazy histonowe i deacetylazy histonowe katalizują reakcje odpowiednio dodawania i usuwania grup acetylowych do grup ε-aminowych lizyny. Deacetylacja histonów zwiększa dodatni ładunek przez protonację grupy ε-aminowej, co prowadzi do silniejszego oddziaływania elektrostatycznego między histonami a ujemnie naładowanym DNA. W rezultacie chromatyna jest bardziej skondensowana i transkrypcja zahamowana. Acetylaza histonowa przenosi grupę acetylową z acetylo-CoA na grupę ε-aminową reszty lizyny, neutralizuje jej dodatni ładunek i zwiększa hydrofobowość, co rozluźnia strukturę chromatyny i ułatwia dostęp maszynerii transkrypcyjnej do DNA. Przyłączanie czynników transkrypcyjnych i kompleksów remodelujących chromatynę typowo odbywa się dzięki rozpoznającej acetylowane reszty lizyny. Ponadto mechanizmy acetylacji/deacetylacji występują również u wielu niehistonowych białek jak czynniki transkrypcyjne, wpływając na ekspresję genów i inne procesy komórkowe.
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Na acetilação e deacetilação de histona, as histonas são acetiladas e deacetiladas em resíduos de lisina na ramificação N-terminal como parte da regulação genética. Tipicamente, estas reações são catalisadas por enzimas com atividade "histona acetiltransferase" (HAT) ou "histona deacetilase" (HDAC ou HD). Diversas formas de HATs e HDs têm sido identificadas. Entre eles, CBP/p300 é provavelmente a mais importante, devido a poder interagir com numerosos reguladores de transcrição. A fonte do grupo acetila na acetilação da histona é a Acetil-Coenzima A, e na deacetilação da histona o grupo acetila é transferido para a Coenzima A. Histonas acetiladas e nucleossomas representam um tipo de marco epigenético dentro da cromatina. Ligações atuam em uma carga negativa, atuando em neutralizar a carga positiva sobre as histonas e diminuindo a interação das terminações N das histonas com os grupos fosfato negativamente carregados do DNA. Como uma consequência, a cromatina condensada é transformada em uma estrutura relaxada a qual é associada com maiores níveis de transcrição de genes. Este relaxamento pode ser revertido pela atividade HDAC. Relaxada, o DNA transcricionalmente ativo é relacionado à eucromatina. A condensação pode ser conduzida por processos incluindo deacetilação e metilação; a ação de metilação é indireta e não tem efeito sobre a carga. A acetilação dos resíduos de lisina na terminação N de proteínas de histona remove cargas positivas, desse modo reduzindo a afinidade entre histonas e DNA. Isto faz a polimerase de RNA e os fatores de transcrição mais facilmente acessar a região propiciada. Conseqüentemente, na maioria dos casos, a acetilação da histona realça a transcrição, enquanto a desacetilação da histona reprime a transcrição. Estudos recentes têm demonstrado o recrutamento de enzimas modificadas da cromatina na quebra de cadeias duplas, assim como a participação no reparo destas cadeias duplas quebradas. Tais mecanismos são intimamente relacionados a lisina de histona e sua acetilação e deacetilação. Este modelo de neutralização da carga tem sido desafiado por recentes estudos, pelos quais genes transcricionalmente ativos têm sido relacionados com rápida reversão da acetilação de histona. Isto requer que as HATs e HDACs devam atuar continuamente sobre as terminações afetadas da histona. Metilação em um resíduo específico de lisina (K4) está envolvido em marcação de terminações de histona para acetilação e deacetilação contínuas. Estes mecanismos são inclusive pesquisados in vivo,, em leveduras (como a Saccharomyces cerevisiae. A acetilação e deacetilação de histona são processos coordenados conduzindo a uma distribuição não aleatória de isoformas. Estudam-se a importância da acetilação e deacetilação de histona nas doenças inflamatórias dos pulmões, por aumento da expressão de genes inflamatórios que são regulados por fatores de transcrição.
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組蛋白乙醯化(Histone acetylation)為真核生物染色體上包裹DNA的組蛋白N端之離胺酸被乙醯化的轉譯後修飾,為細胞調控基因表現的一種機制。此反應一般由組蛋白乙醯轉移酶(HAT)催化,组蛋白脱乙酰酶(HDAC)則可催化其逆反應組蛋白脫乙醯化( Histone deacetylation),將組蛋白上的乙醯基水解移除。組蛋白乙醯化是為一種表觀遺傳修飾,乙醯基化會消除組蛋白離胺酸所帶的正電荷,使其與DNA(帶負電)的結合力降低,因此可將原本纏繞較緊密的染色體結構(異染色質)轉成較疏鬆的型態(真染色質),有利於轉錄的進行而提升基因表現;組蛋白脫乙醯化的功能則與之相反,可使染色體結構變得更緊密而降低基因表現。 組蛋白上不同位點的多種修飾(包括乙醯化、甲基化、磷酸化等)可能組合成組蛋白密碼,共同影響染色體結構,並與細胞中的其他蛋白結合以調控基因的轉錄,例如具有布罗莫结构域的蛋白(包括許多轉錄因子)可與被乙醯化的組蛋白結合 。組蛋白密碼與DNA甲基化皆為的一部份。 組蛋白乙醯化調控許多基因的表現,因此其調控異常與發炎性疾病、心血管疾病、和多種癌症相關。此外對菸酒和藥物的成癮機制可能也與其促進染色體特定區域的組蛋白乙醯化以影響基因表現有關。
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