Genome Reference Consortium
http://dbpedia.org/resource/Genome_Reference_Consortium an entity of type: WikicatConsortia
الجمعية المرجعية للجينوم أو الاتحاد المرجعي للجينوم (GRC) هي مجموعة دولية من المعاهد الأكاديمية والبحثية ذات الخبرة في رسم خرائط الجينوم وتسلسلها والمعلوماتية، وقد تأسست بغرض تحسين تمثيل الجينومات المرجعية. الجمعية المرجعية للجينوم هي مشروع تعاوني يتفاعل مع مجموعات مختلفة في المجتمع العلمي. المعاهد الأعضاء الأساسيين هم:
*
* في جامعة واشنطن.
* معهد المعلوماتية الحيوية الأوروبي.
* المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية.
* قاعدة بيانات سمك الزيبرا (دانيو مخطط).
* قاعدة بيانات جينوم الفئران.
rdf:langString
El Consorcio de Referencia del Genoma (Genome Reference Consortium o GRC, en inglés) es un conjunto internacional de institutos académicos y de investigación con experiencia en mapeo, secuenciación e informática de genomas, creado para mejorar la representación de genomas de referencia. Cuando se describió por primera vez el genoma de referencia humano, quedó claro que algunas regiones eran reacias al análisis con la tecnología existente, lo que dejaba "huecos" en la secuencia conocida. La razón principal para mejorar los ensamblados de referencia es que son los pilares fundamentales sobre los que se basan todos los estudios de genoma completo (ej.: el Proyecto 1000 Genomas).
rdf:langString
The Genome Reference Consortium (GRC) is an international collective of academic and research institutes with expertise in genome mapping, sequencing, and informatics, formed to improve the representation of reference genomes. At the time the human reference was initially described, it was clear that some regions were recalcitrant to analysis with existing technology, leaving gaps in the known sequence. The main reason for improving the reference assemblies are that they are the cornerstones upon which all whole genome studies are based (e.g. the 1000 Genomes Project).
rdf:langString
rdf:langString
الجمعية المرجعية للجينوم
rdf:langString
Consorcio de Referencia del Genoma
rdf:langString
Genome Reference Consortium
xsd:integer
21323317
xsd:integer
1106887202
rdf:langString
الجمعية المرجعية للجينوم أو الاتحاد المرجعي للجينوم (GRC) هي مجموعة دولية من المعاهد الأكاديمية والبحثية ذات الخبرة في رسم خرائط الجينوم وتسلسلها والمعلوماتية، وقد تأسست بغرض تحسين تمثيل الجينومات المرجعية. عندما وُصف المرجع البشري لأول مرة، كان من الواضح أن بعض المناطق كانت معارضة للتحليل باستخدام التكنولوجيا المتاحة، مما تسبب في فجوات في التسلسل المعروف. عندما تم وصف المرجع البشري لأول مرة ، كان من الواضح أن بعض المناطق كانت مقاومة للتحليل باستخدام التكنولوجيا المتاحة ، مما يترك فجوات في التسلسل المعروف. المبرر الأساسي لتحسين التجميعات المرجعية هو أنها تعمل كأساس لجميع دراسات الجينوم الكاملة (على سبيل المثال ). الجمعية المرجعية للجينوم هي مشروع تعاوني يتفاعل مع مجموعات مختلفة في المجتمع العلمي. المعاهد الأعضاء الأساسيين هم:
*
* في جامعة واشنطن.
* معهد المعلوماتية الحيوية الأوروبي.
* المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية.
* قاعدة بيانات سمك الزيبرا (دانيو مخطط).
* قاعدة بيانات جينوم الفئران. تهدف الجمعية إلى تصحيح العدد الصغير من المناطق في المرجع التي يتم تمثيلها بشكل خاطئ حاليًا، وسد أكبر عدد ممكن من الفجوات المتبقية وإنتاج تجميعات بديلة لموقع كروموسومي متغير عند الضرورة. كان التركيز في البداية على الجينوم المرجعي للإنسان والفأر، ولكن مع توسع الجمعية تم تضمين المزيد من الكائنات الحية. تلقى مركز الخليج للأبحاث في أكتوبر 2010 الصيانة الكاملة وتحسين تسلسل جينوم سمك الزيبرا. إضيف الجينوم المرجعي للدجاج إلى مركز الخليج للأبحاث في عام 2015، وأضيفت مجموعة جينوم الفئران إلى مركز الخليج للأبحاث في نوفمبر 2020. اعتبارًا من سبتمبر 2019، كانت إصدارات التجميع الرئيسية للإنسان والفأر وسمك الزرد والدجاج هي GRCh38 و GRCm38 و GRCz11 و GRCg6a على التوالي. إصدارات التجميع الرئيسية لا تتبع دورة ثابتة؛ ومع ذلك هناك تحديثات تجميعية طفيفة في شكل بقع الجينوم والتي إما تصحح الأخطاء في التجميع أو تضيف مواقع بديلة إضافية. يتم تمثيل هذه التجميعات في متصفحات وقواعد بيانات مختلفة للجينوم بما في ذلك مشروع قاعدة بيانات الجينوم إنسنبل وتلك الموجودة في المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية و .
rdf:langString
The Genome Reference Consortium (GRC) is an international collective of academic and research institutes with expertise in genome mapping, sequencing, and informatics, formed to improve the representation of reference genomes. At the time the human reference was initially described, it was clear that some regions were recalcitrant to analysis with existing technology, leaving gaps in the known sequence. The main reason for improving the reference assemblies are that they are the cornerstones upon which all whole genome studies are based (e.g. the 1000 Genomes Project). The GRC is a collaborative effort which interacts with various groups in the scientific community. The primary member institutes are:
* The Wellcome Sanger Institute
* The McDonnell Genome Institute at Washington University
* The European Bioinformatics Institute
* The National Center for Biotechnology Information
* Zebrafish Model Organism Database
* Rat Genome Database The goal of the Consortium is to correct the small number of regions in the reference that are currently misrepresented, to close as many remaining gaps as possible and to produce alternative assemblies of structurally variant loci when necessary. Initially the focus was on the human and mouse reference genomes, but in expansions new organisms were added to the consortium. In October 2010 full maintenance and improvement of the zebrafish genome sequence was added to the GRC; in 2015, after the release of the chicken genome assembly Gallus_gallus-5.0, GRC added the chicken reference genome, and in November 2020 the rat genome assembly was added. As of September 2019, the major assembly releases for human, mouse, zebrafish, and chicken are GRCh38, GRCm38, GRCz11, and GRCg6a, respectively. Major assembly releases do not follow a fixed cycle; however, there are minor assembly updates in the form of genome patches which either correct errors in the assembly or add additional alternate loci. These assemblies are represented in various genome browsers and databases including Ensembl, those in NCBI and UCSC Genome Browser.
rdf:langString
El Consorcio de Referencia del Genoma (Genome Reference Consortium o GRC, en inglés) es un conjunto internacional de institutos académicos y de investigación con experiencia en mapeo, secuenciación e informática de genomas, creado para mejorar la representación de genomas de referencia. Cuando se describió por primera vez el genoma de referencia humano, quedó claro que algunas regiones eran reacias al análisis con la tecnología existente, lo que dejaba "huecos" en la secuencia conocida. La razón principal para mejorar los ensamblados de referencia es que son los pilares fundamentales sobre los que se basan todos los estudios de genoma completo (ej.: el Proyecto 1000 Genomas). El GRC es un esfuerzo colaborativo en el que están implicados varios grupos de la comunidad científica, siendo los principales institutos miembros los siguientes:
* Instituto Wellcome Sanger
* El Instituto del Genoma McDonnell de la Universidad de Washington
* El Instituto Europeo de Bioinformática (EBI)
* El Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI)
* Base de datos del organismo modelo pez cebra (ZFIN)
* Base de datos del genoma de rata (RGD) Inicialmente, el GRC se centró en los genomas de referencia humanos y murino, pero en posteriores expansiones se agregaron nuevos organismos al consorcio. En octubre de 2010, se incluyó en el GRC el mantenimiento completo y la mejora de la secuencia del genoma del pez cebra, en 2015, después del lanzamiento de la versión del genoma de pollo Gallus_gallus-5.0, GRC agregó el genoma de referencia del pollo y en noviembre de 2020 también se agregó el genoma de rata. El objetivo del GRC es corregir las regiones infrarrepresentadas actualmente en las secuencias de referencia, eliminar tantos huecos como sea posible en estas y generar ensamblados alternativos de loci con una alta variabilidad estructural cuando sea necesario. A fecha de septiembre de 2019, los genomas de referencia más relevantes publicados para humano, ratón, pez cebra y pollo eran GRCh38, GRCm38, GRCz11 y GRCg6a, respectivamente. Los principales lanzamientos no siguen un calendario establecido de publicaciones, sin embargo, hay actualizaciones de ensamblados "menores" en forma de parches que corrigen errores en el ensamblado o agregan loci alternativos adicionales. Estos ensamblados se pueden consultar en diferentes visores genómicos y bases de datos, incluidos Ensembl, los de NCBI y UCSC Genome Browser .
xsd:nonNegativeInteger
6975
