Dot plot (bioinformatics)
http://dbpedia.org/resource/Dot_plot_(bioinformatics) an entity of type: Software
في المعلوماتية الحيوية نقطة مؤامرة هي طريقة رسومية تسمح بمقارنة اثنين من التسلسل البيولوجي وتحديد مناطق تشابه وثيقة بينهما. بل هو نوع من أشكال التكرار.
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Dot plot je nejjednodušší bioinformatickou metodou pro srovnávání 2 sekvencí, tzv. pairwise sequence alignment.
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In bioinformatics a dot plot is a graphical method for comparing two biological sequences and identifying regions of close similarity after sequence alignment. It is a type of recurrence plot.
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バイオインフォマティクスにおけるドットプロット（Dot plot）とは、蛋白質のアミノ酸配列または核酸の塩基配列を互いに比較し相同性を明らかにするためのグラフである。考案者Robert Harrにちなみハー・プロット（Harr plot）とも呼ばれる。縦軸（上から下へ）および横軸（左から右へ）に各配列をとり、一致した点にプロットする。すると同じ配列がある部分には線が現れるため、相同性を直感的に確認することができる。 例のように両軸に全く同じ配列（例えば同じ遺伝子）をとれば、右下がりの対角線が現れ、全体としてはこれを中心として対称な図形となり、そのほかにも部分的な相同性があれば右下がりの短い線が現れる。また、ゲノムまたはその一部の塩基配列を対象とした場合、対角線以外に長い線が現れれば、これは遺伝子重複を表す。また右下がりだけでなく右上がりの線が現れることもあり、これは相同性のある配列の方向が逆転していること（逆位）を表す。これは比較ゲノミクスに有用な方法である。
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Ein Dotplot (englisch für „Punktauftragung“) ist eine graphische Methode der Bioinformatik zwei biologische Sequenzen miteinander (oder eine Sequenz mit sich selbst) zu vergleichen. Dabei werden die Sequenzen auf die horizontale und vertikale Achse (oben und links) aufgetragen und Übereinstimmungen zwischen einer Zeile und Spalte an der entsprechenden Schnittstelle durch einen Punkt (englisch „dot“) markiert.
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مخطط نقطي
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Dot plot
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Dotplot
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Dot plot (bioinformatics)
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ドットプロット (バイオインフォマティクス)
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2016-10-03
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في المعلوماتية الحيوية نقطة مؤامرة هي طريقة رسومية تسمح بمقارنة اثنين من التسلسل البيولوجي وتحديد مناطق تشابه وثيقة بينهما. بل هو نوع من أشكال التكرار.
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Dot plot je nejjednodušší bioinformatickou metodou pro srovnávání 2 sekvencí, tzv. pairwise sequence alignment.
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Ein Dotplot (englisch für „Punktauftragung“) ist eine graphische Methode der Bioinformatik zwei biologische Sequenzen miteinander (oder eine Sequenz mit sich selbst) zu vergleichen. Dabei werden die Sequenzen auf die horizontale und vertikale Achse (oben und links) aufgetragen und Übereinstimmungen zwischen einer Zeile und Spalte an der entsprechenden Schnittstelle durch einen Punkt (englisch „dot“) markiert. Der Dotplot dient der Auffindung von ähnlichen bzw. übereinstimmenden Regionen. Diese Darstellung wurde erstmals 1970 von Gibbs und McIntyre publiziert und wurde seitdem weiterentwickelt. Obwohl fast 50 Jahre alt, finden Dotplots noch immer Eingang in aktuelle Publikationen, wie z. B. bei der Analyse der epigenetischen Steuerung in Pflanzen.
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In bioinformatics a dot plot is a graphical method for comparing two biological sequences and identifying regions of close similarity after sequence alignment. It is a type of recurrence plot.
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バイオインフォマティクスにおけるドットプロット（Dot plot）とは、蛋白質のアミノ酸配列または核酸の塩基配列を互いに比較し相同性を明らかにするためのグラフである。考案者Robert Harrにちなみハー・プロット（Harr plot）とも呼ばれる。縦軸（上から下へ）および横軸（左から右へ）に各配列をとり、一致した点にプロットする。すると同じ配列がある部分には線が現れるため、相同性を直感的に確認することができる。 例のように両軸に全く同じ配列（例えば同じ遺伝子）をとれば、右下がりの対角線が現れ、全体としてはこれを中心として対称な図形となり、そのほかにも部分的な相同性があれば右下がりの短い線が現れる。また、ゲノムまたはその一部の塩基配列を対象とした場合、対角線以外に長い線が現れれば、これは遺伝子重複を表す。また右下がりだけでなく右上がりの線が現れることもあり、これは相同性のある配列の方向が逆転していること（逆位）を表す。これは比較ゲノミクスに有用な方法である。
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