DNA-binding domain

rdf:langString DNA 결합 도메인

rdf:langString DNA 결합 도메인(DNA Binding Domain, DBD)은 이중 또는 단일 가닥 DNA를 인식하는 하나 이상의 구조적 모티프를 포함하는 독립적으로 접힌 단백질 도메인이다. DNA 결합 도메인은 특정 DNA 서열을 인식하거나 DNA에 대한 일반적인 친화성을 가질 수 있다. 일부 DNA 결합 도메인은 접힌 구조에 핵산을 포함할 수도 있다. 하나 이상의 DNA 결합 도메인은 종종 기능이 다른 추가 단백질 도메인으로 구성된 더 큰 단백질의 일부이다. 종종 여분의 도메인은 DNA 결합 도메인의 활성을 조절한다. DNA 결합의 기능은 구조적이거나 전사 조절을 포함하며 두 역할이 때때로 겹치기도 한다. DNA 구조를 포함하는 기능을 가진 DNA 결합 도메인은 DNA 복제, DNA 수선, 저장, DNA 메틸화와 같은 변형에 생물학적 역할을 한다. 유전자 발현의 조절에 관여하는 많은 단백질은 DNA 결합 도메인을 포함한다. 예를 들어, DNA와 결합함으로써 전사를 조절하는 단백질은 전사인자라고 불린다. 대부분의 세포 신호 캐스케이드의 최종 산출물은 유전자 조절이다. DNA 결합 도메인은 DNA 서열 특이적 또는 비서열 특이적 방식으로 DNA의 뉴클레오타이드와 상호작용하지만, 비서열 특이적 인식조차도 단백질과 DNA 사이의 일종의 분자 상보성을 포함한다. DNA 결합 도메인에 의한 DNA 인식은 DNA의 메이저 홈, 마이너 홈 또는 당-인산염 DNA 골격에서 발생한다. 각 특정 유형의 DNA 인식은 단백질의 기능에 맞게 조정된다. 예를 들어, DNA 절단 효소인 DNA 분해 효소 I (DNAse I)은 DNA를 거의 무작위로 절단하므로 비서열 특이적 방식으로 DNA에 결합해야 한다. 그러나 그럼에도 불구하고 DNA 분해 효소는 특정 3차원 DNA 구조를 인식하여 DNA 발자국이라는 기술로 DNA 인식을 연구하는 데 유용할 수 있는 다소 특정한 DNA 절단 패턴을 생성한다. 많은 DNA 결합 도메인은 특정 유전자를 활성화하는 전사 인자의 DNA 결합 도메인 또는 제한 효소 및 텔로머레이스와 같은 특정 부위에서 DNA를 수정하는 효소의 DNA 결합 도메인과 같은 특정 DNA 서열을 인식해야 한다. DNA 메이저 홈의 수소 결합 패턴은 DNA 마이너 홈보다 덜 퇴화되어 서열 특이적 DNA 인식에 더 좋은 영향을 준다. DNA 결합 단백질의 특이성은 겔 전기 영동법, 분석 초원심분리, 열량계, DNA 돌연변이, 단백질의 구조 돌연변이 또는 변형, 핵자기 공명, 엑스선 결정학, 표면 플라즈몬 공명, 전자 스핀 공명과 같은 많은 생화학적 및 생물 물리학적 기술을 사용하여 연구할 수 있다.