Chromosome conformation capture
http://dbpedia.org/resource/Chromosome_conformation_capture an entity of type: TopicalConcept
染色体构象捕获（英語：Chromosome conformation capture，简称为3C）是一种用于分析细胞自然状态下染色体组织形式的分子生物学技术。对于理解并评价、DNA复制和修复来说，研究染色体的结构性质和空间组织是尤为重要的。 影响基因表达的染色质相互作用的例子之一是：染色体区域折叠可以将增强子及相关转录因子带到基因附近，这一点首次在结构域中获得证实。染色体构象捕获使得研究者们可以根据上述的细胞机制来研究对染色质活性产生影响的因素。这一技术对研究模式生物和人体中遗传学及表观遗传学很有帮助。 基于原始的3C技术，现已发展出多项新的技术，这些技术可增加一条染色体与其它染色体及其它蛋白之间进行定量的通量。这些所有的3C相关的技术大致可被分为四类：（1）3C和ChIP版本的3C（ChIP-loop assay）、（2）4C和ChIP版本的4C（增强型4C）、（3）5C和3D检测以及（4）基因组构象捕获（GCC）相关技术（Hi-C）和ChIP版本的GCC（也被称为6C）。在4C、5C和Hi-C中通过微阵列和高通量测序手段对DNA片段进行分析的应用使得对染色体交互作用的分析进入全基因组规模。
rdf:langString
Chromosome conformation capture (dt. "Konformationserfassung von Chromosomen", oft abgekürzt mit 3C-Technologien oder 3C-basierte Methoden) sind eine Reihe von molekularbiologischen Methoden, mit denen die räumliche Organisation von Chromatin in einer Zelle analysiert wird. Diese Methoden quantifizieren die Anzahl der Wechselwirkungen zwischen genomischen Loci, die sich im dreidimensionalen Raum in unmittelbarer Nähe befinden, aber im linearen Genom durch viele Nukleotide getrennt sein können. Solche Wechselwirkungen können sich aus biologischen Funktionen, wie z. B. Promotor-Enhancer-Wechselwirkungen, oder aus einer zufälligen Schleifenbildung ergeben, bei der eine ungerichtete physikalische Bewegung des Chromatins zu einer Kollision der Loci führt. Die Frequenz dieser Interaktionen könne
rdf:langString
Chromosome conformation capture techniques (often abbreviated to 3C technologies or 3C-based methods) are a set of molecular biology methods used to analyze the spatial organization of chromatin in a cell. These methods quantify the number of interactions between genomic loci that are nearby in 3-D space, but may be separated by many nucleotides in the linear genome. Such interactions may result from biological functions, such as promoter-enhancer interactions, or from random polymer looping, where undirected physical motion of chromatin causes loci to collide. Interaction frequencies may be analyzed directly, or they may be converted to distances and used to reconstruct 3-D structures.
rdf:langString
Las técnicas de captura de la conformación de los cromosomas (a menudo abreviados a tecnologías 3C) son un conjunto de métodos de biología molecular utilizados para analizar la organización espacial de cromatina en una célula. Estos métodos cuantifican el número de interacciones entre loci genómicos que están próximos en el espacio 3-D, pero pueden estar separados por muchos nucleótidos en el genoma lineal. Las frecuencias de interacción pueden ser analizadas directamente, o pueden ser convertidas a distancias y utilizadas para reconstruir estructuras 3D .
rdf:langString
Определе́ние конформа́ции хромосо́м, часто сокращённо называемые 3C (англ. chromosome conformation capture, 3C) — набор методов молекулярной биологии, используемых для изучения пространственной организации хроматина в ядре клетки. Их применяют для количественной оценки взаимодействий между геномными локусами, расположенными рядом в трёхмерном пространстве. Частоты взаимодействий могут быть проанализированы напрямую или преобразованы в расстояния и использованы для реконструкции трёхмерных структур.
rdf:langString
Методи фіксації конформації хромосом, часто скорочено до 3С-технологій або методів на основі 3С (англ. Chromosome conformation capture, 3C) — це набір методів молекулярної біології, що використовуються для аналізу просторової організації хроматину в ядрі клітини. Їх застосовують для кількісної оцінки взаємодій між геномними локусами, які розташовані поблизу в тривимірному просторі, але можуть бути розділені багатьма нуклеотидами в лінійному геномі. Такі взаємодії можуть виникати внаслідок біологічних функцій, наприклад, між промотором і енхансером або в результаті випадкового утворення петель полімеру, коли непрямий фізичний рух хроматину викликає «зіткнення» локусів. При цьому регуляторні елементи можуть розташовуватися на відстані декількох мільйонів пар основ від генів, експресію яких в
rdf:langString
rdf:langString
Chromosome conformation capture
rdf:langString
Método de captura de la conformación de los cromosomas
rdf:langString
Chromosome conformation capture
rdf:langString
Определение конформации хромосом
rdf:langString
染色体构象捕获
rdf:langString
Методи фіксації конформації хромосом
xsd:integer
14083910
xsd:integer
1112978120
rdf:langString
Chromosome conformation capture (dt. "Konformationserfassung von Chromosomen", oft abgekürzt mit 3C-Technologien oder 3C-basierte Methoden) sind eine Reihe von molekularbiologischen Methoden, mit denen die räumliche Organisation von Chromatin in einer Zelle analysiert wird. Diese Methoden quantifizieren die Anzahl der Wechselwirkungen zwischen genomischen Loci, die sich im dreidimensionalen Raum in unmittelbarer Nähe befinden, aber im linearen Genom durch viele Nukleotide getrennt sein können. Solche Wechselwirkungen können sich aus biologischen Funktionen, wie z. B. Promotor-Enhancer-Wechselwirkungen, oder aus einer zufälligen Schleifenbildung ergeben, bei der eine ungerichtete physikalische Bewegung des Chromatins zu einer Kollision der Loci führt. Die Frequenz dieser Interaktionen können direkt analysiert werden, oder sie können in Abstände umgewandelt und zur Rekonstruktion von 3D-Strukturen verwendet werden. Diese Technologie hat die genetische und epigenetische Untersuchung von Chromosomen sowohl in Modellorganismen als auch beim Menschen weiter unterstützt. Der Hauptunterschied zwischen 3C-basierten Methoden besteht in ihrem Umfang. Wenn beispielsweise PCR zum Nachweis von Wechselwirkungen in einem 3C-Experiment verwendet wird, dann werden die Wechselwirkungen zwischen zwei spezifischen Fragmenten quantifiziert. Im Gegensatz dazu quantifiziert die Hi-C-Methode die Wechselwirkungen zwischen allen möglichen Paaren von Fragmenten gleichzeitig.
rdf:langString
Chromosome conformation capture techniques (often abbreviated to 3C technologies or 3C-based methods) are a set of molecular biology methods used to analyze the spatial organization of chromatin in a cell. These methods quantify the number of interactions between genomic loci that are nearby in 3-D space, but may be separated by many nucleotides in the linear genome. Such interactions may result from biological functions, such as promoter-enhancer interactions, or from random polymer looping, where undirected physical motion of chromatin causes loci to collide. Interaction frequencies may be analyzed directly, or they may be converted to distances and used to reconstruct 3-D structures. The chief difference between 3C-based methods is their scope. For example, when using PCR to detect interaction in a 3C experiment, the interactions between two specific fragments are quantified. In contrast, Hi-C quantifies interactions between all possible pairs of fragments simultaneously. Deep sequencing of material produced by 3C also produces genome-wide interactions maps.
rdf:langString
Las técnicas de captura de la conformación de los cromosomas (a menudo abreviados a tecnologías 3C) son un conjunto de métodos de biología molecular utilizados para analizar la organización espacial de cromatina en una célula. Estos métodos cuantifican el número de interacciones entre loci genómicos que están próximos en el espacio 3-D, pero pueden estar separados por muchos nucleótidos en el genoma lineal. Las frecuencias de interacción pueden ser analizadas directamente, o pueden ser convertidas a distancias y utilizadas para reconstruir estructuras 3D . La diferencia entre los métodos 3C está en su objetivo. Por ejemplo, cuando se utiliza una PCR para detectar interacción en un experimento 3C, se cuantifican las interacciones entre dos fragmentos concretos. En contraste, Hi-C cuantifica interacciones entre todos los pares posibles de fragmentos simultáneamente. La secuenciación profunda del material producido por 3C también produce mapas de interacciones de todo el genoma.
rdf:langString
Методи фіксації конформації хромосом, часто скорочено до 3С-технологій або методів на основі 3С (англ. Chromosome conformation capture, 3C) — це набір методів молекулярної біології, що використовуються для аналізу просторової організації хроматину в ядрі клітини. Їх застосовують для кількісної оцінки взаємодій між геномними локусами, які розташовані поблизу в тривимірному просторі, але можуть бути розділені багатьма нуклеотидами в лінійному геномі. Такі взаємодії можуть виникати внаслідок біологічних функцій, наприклад, між промотором і енхансером або в результаті випадкового утворення петель полімеру, коли непрямий фізичний рух хроматину викликає «зіткнення» локусів. При цьому регуляторні елементи можуть розташовуватися на відстані декількох мільйонів пар основ від генів, експресію яких вони контролюють. Незважаючи на це, складна конформація ділянки ДНК між ними дозволяє їм безпосередньо взаємодіяти один з одним. Частоти взаємодій можуть бути проаналізовані безпосередньо або конвертовані у відстані та використані для реконструкції 3D структур. Основні відмінності методів на основі 3C — це їх можливості і область застосування. Наприклад, при використанні ПЛР для виявлення взаємодії в експерименті 3С кількісно оцінюються взаємодії двох конкретних фрагментів. Навпаки, Hi-C кількісно визначає взаємодію між усіма можливими парами фрагментів одночасно. Глибоке секвенування матеріалу, отриманого за допомогою 3C, також дозволяє скласти карти взаємодій цілого генома.
rdf:langString
Определе́ние конформа́ции хромосо́м, часто сокращённо называемые 3C (англ. chromosome conformation capture, 3C) — набор методов молекулярной биологии, используемых для изучения пространственной организации хроматина в ядре клетки. Их применяют для количественной оценки взаимодействий между геномными локусами, расположенными рядом в трёхмерном пространстве. Такие взаимодействия могут возникать как следствие биологических функций, например, между промотором и энхансером или в результате случайного образования петель полимера, когда физическое движение хроматина вызывает «столкновение» локусов. При этом регуляторные элементы могут располагаться на расстоянии нескольких миллионов пар оснований от генов, которые они контролируют. Несмотря на то, что располагается на расстоянии нескольких десятков килобаз от генов, сложная конформация участка ДНК между ними позволяет им непосредственно взаимодействовать друг с другом, благодаря чему контролируется экспрессия генов. Частоты взаимодействий могут быть проанализированы напрямую или преобразованы в расстояния и использованы для реконструкции трёхмерных структур. Основные различия методов на основе 3C — это их возможности и область применения. Глубокое секвенирование материала, полученного с помощью 3C, также позволяет составить полногеномные карты взаимодействий.
rdf:langString
染色体构象捕获（英語：Chromosome conformation capture，简称为3C）是一种用于分析细胞自然状态下染色体组织形式的分子生物学技术。对于理解并评价、DNA复制和修复来说，研究染色体的结构性质和空间组织是尤为重要的。 影响基因表达的染色质相互作用的例子之一是：染色体区域折叠可以将增强子及相关转录因子带到基因附近，这一点首次在结构域中获得证实。染色体构象捕获使得研究者们可以根据上述的细胞机制来研究对染色质活性产生影响的因素。这一技术对研究模式生物和人体中遗传学及表观遗传学很有帮助。 基于原始的3C技术，现已发展出多项新的技术，这些技术可增加一条染色体与其它染色体及其它蛋白之间进行定量的通量。这些所有的3C相关的技术大致可被分为四类：（1）3C和ChIP版本的3C（ChIP-loop assay）、（2）4C和ChIP版本的4C（增强型4C）、（3）5C和3D检测以及（4）基因组构象捕获（GCC）相关技术（Hi-C）和ChIP版本的GCC（也被称为6C）。在4C、5C和Hi-C中通过微阵列和高通量测序手段对DNA片段进行分析的应用使得对染色体交互作用的分析进入全基因组规模。
xsd:nonNegativeInteger
48684
