AlphaFold
http://dbpedia.org/resource/AlphaFold an entity of type: Thing
ألفافولد (بالإنجليزية: AlphaFold) هو برنامج ذكاء اصطناعي مطور من شركة ديب مايند بهدف توقّع بنية البروتينات؛ وهو مصمم على هيئة نظام قادر على إنجاز التعلّم المتعمّق. نشرت النسخة الأولى من هذا البرنامج سنة 2018، وحل في المرتبة الأولى ضمن برامج التقدير التوقعي لبنية البروتين (CASP)؛ أما النسخة الثانية منه فنشرت أواخر سنة 2020. كانت نتائج النسخة الثانية من البرنامج ذات وقع في المجتمع العلمي؛ وهي متاحة مع برمجيات حرة المصدر للبحث ضمن قواعد بيانات عن المجموع البروتيني (بروتيوم) للأنواع والكائنات الحية.
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AlphaFold ist ein Programm, das Deep Learning nutzt, um eine Proteinstruktur basierend auf der Aminosäuresequenz des Proteins vorherzusagen. Das Programm wurde vom in London ansässigen Unternehmen Deepmind entwickelt und erreichte beim Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction (CASP) Wettbewerb 2018 und 2020 Bestwerte.In der medizinischen Fachwelt wurde dies als Durchbruch der Proteinstrukturvorhersage aufgenommen.Seit dem 15. Juli 2021 unterliegt die Software einer Open-Source-Lizenz – auch für kommerzielle Unternehmen. Zudem wurde die Funktionsweise im Fachjournal Nature veröffentlicht.Jeder kann jetzt Proteine falten oder in Datenbanken (wie der AlphaFold Protein Structure Database) mit automatisch generierten Modellen nachschauen.
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AlphaFold est un logiciel d'intelligence artificielle développé par DeepMind, appartenant à Google, qui cherche à prédire la structure des protéines à partir de leur séquence en acides aminés. Le programme est conçu comme un système d'apprentissage profond.
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AlphaFold je umělá inteligence vyvinutá britskou společností spadající pod Google, která se již v minulosti proslavila umělými inteligencemi schopnými hrát a zejména vyhrát ve složitých hrách jako je Go či StarCraft. Jde o software využívající několikavrstevnou umělou neuronovou síť, jež na základě hlubokého učení (podtyp strojového učení) dokáže z primární struktury proteinu určit jeho výslednou konformaci.
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AlphaFold is an artificial intelligence (AI) program developed by DeepMind, a subsidiary of Alphabet, which performs predictions of protein structure. The program is designed as a deep learning system. AlphaFold 2's results at CASP were described as "astounding" and "transformational." Some researchers noted that the accuracy is not high enough for a third of its predictions, and that it does not reveal the mechanism or rules of protein folding for the protein folding problem to be considered solved. Nevertheless, there has been widespread respect for the technical achievement.
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AlphaFold es un programa de inteligencia artificial (IA) desarrollado por DeepMind de Alphabets/Google que realiza predicciones de la estructura de las proteínas mediante el sistema de aprendizaje profundo.La primera versión de AlphaFold, conocida como AlphaFold 1, obtuvo el primer lugar en la clasificación general de la 13.ª edición de la competición CASP (Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction, 'evaluación crítica de técnicas para la predicción de la estructura de proteínas') en diciembre de 2018. El programa se destacó particularmente en las predicciones de estructuras para las que no existían modelos previos, consideradas por los organizadores de la competición como las más difíciles.
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AlphaFold è un programma di intelligenza artificiale sviluppato da DeepMind (Alphabet/Google) per predire la struttura tridimensionale delle proteine.Il programma è stato progettato come un sistema di deep learning. il software di AlphaFold è stato rilasciato in due versioni. La prima nel 2018 AlphaFold 1 col quale un'equipe di ricercatori si è posizionata al primo posto del 13° (Valutazione critica di tecniche per la predizione della struttura delle proteine). Il 28 luglio 2022 vengono pubblicate le strutture di oltre 200 milioni di proteine.
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AlphaFold(アルファフォールド)は、タンパク質の構造予測を実行するGoogleのDeepMindによって開発された人工知能プログラムである。このプログラムは、タンパク質の折り畳み構造を原子の幅に合わせて予測する深層学習システムとして設計されている。 AIソフトウェア「AlphaFold」は、2つの主要バージョンで注目されている。研究者チームはAlphaFold 1 (2018年) を使用して、2018年12月に開催された「第13回 タンパク質構造予測精密評価 (CASP)」の総合ランキングで1位を獲得した。このプログラムは、部分的に類似した配列を持つタンパク質から既存のが利用できない、競技会主催者によって最も難しいと評価されたターゲットの最も正確な構造を予測することに特に成功した。チームは、AlphaFold 2 (2020年) を使用して、2020年11月のCASPコンテストに参加した。チームは、他のどのグループよりもはるかに高い精度を達成した。このプログラムは、CASPのグローバル距離テスト (GDT) において、約3分の2のタンパク質について90以上のスコアを獲得した。これは計算プログラムが予測した構造がラボ実験で決定された構造と類似している度合いを測定するテストで、GDTの計算に使用される距離のカットオフの範囲内で100が完全な一致である。
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AlphaFold — программа на базе искусственного интеллекта (AI), разработанная Google DeepMind, которая выполняет предсказания пространственной структуры белка. Программа разработана как система глубокого обучения. Результаты AlphaFold 2 в CASP были охарактеризованы как «поразительные». В то же время некоторые исследователи отметили, что точность недостаточно высока для оставшейся трети прогнозов и что не раскрывается механизм и правила сворачивания белка, чтобы проблема сворачивания белка считалась решённой.
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AlphaFold é um programa de inteligência artificial desenvolvido pela DeepMind do Google que realiza . O programa é projetado como um sistema de aprendizagem profunda. O software AlphaFold AI se destacou em duas versões principais. Uma equipe de pesquisadores que usou o AlphaFold 1 (2018) ficou em primeiro lugar na classificação geral da 13ª (CASP em inglês) em dezembro de 2018. O programa foi particularmente bem-sucedido em prever a estrutura mais precisa para alvos classificados como os mais difíceis pelos organizadores da competição, onde nenhuma estrutura de modelo existente estava disponível a partir de proteínas com uma sequência parcialmente semelhante. Uma equipe que usou o AlphaFold 2 (2020) repetiu a colocação na competição CASP em novembro de 2020. A equipe atingiu um nível de p
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AlphaFold(直譯:阿爾法折疊)是Alphabet旗下Google旗下DeepMind开发的一款蛋白質結構預測程式。。該程序被設計為一個深度學習系統。 AlphaFold人工智能有2個主要版本:(2018)和(2020)。前者使用AlphaFold 1在2018年12月的第13屆CASP(英語:Critical Assessment of protein Structure Prediction,直譯:蛋白質結構預測的關鍵評估)的排名中第一。該程序特別成功地預測了被競賽組織者評為最困難的目標的最準確結構,其中沒有來自具有部分相似序列的蛋白質的現有模板結構。 蛋白质卷曲折叠會构成三维结构,蛋白质的功能正由其結構決定。了解蛋白質結構有助於開發治療疾病的藥物。DeepMind稱,AlphaFold能在数天内识别蛋白质的形状,而此前學界識別蛋白质形状經常需花費數年時間。2020年11月,在第14届CASP(英語:Critical Assessment of protein Structure Prediction,直譯:蛋白質結構預測的關鍵評估)競賽中,AlphaFold 2(2020)表現良好,中位分数为92.4(满分100分)。它的准确度远远高于其他任何程序 。
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all UniProt proteomes
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AlphaFold Protein Structure Database
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EMBL-EBI
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AlphaFold je umělá inteligence vyvinutá britskou společností spadající pod Google, která se již v minulosti proslavila umělými inteligencemi schopnými hrát a zejména vyhrát ve složitých hrách jako je Go či StarCraft. Jde o software využívající několikavrstevnou umělou neuronovou síť, jež na základě hlubokého učení (podtyp strojového učení) dokáže z primární struktury proteinu určit jeho výslednou konformaci. Firma s vývojem algoritmu schopného určit tvar proteinu pouze na základě sekvence zbytků aminokyselin započala v roce 2016. Software se učil určovat konformaci na více než 170 000 proteinových strukturách dostupných ve veřejných databázích. V roce 2018 se AlphaFold představil na 13. ročníku CASP (angl. Critical Assessment of protein Structure Prediction, kritické vyhodnocení předpovědi proteinových struktur), bienální konferenci a soutěži testující software určený k modelování terciární struktury proteinů. Již v tomto roce AlphaFold na plné čáře vyhrál a vzbudil údiv pořadatelů. Upravená a vylepšená verze dosáhla na CASP14 v roce 2020 u některých proteinů přesnosti srovnatelné s experimentálními metodami. Možnost podvádění je prakticky vyloučena, AlphaFold dokázal v krátkém čase určit i strukturu membránového proteinu, se kterým se vědci marně trápili 10 let. Až s počítačově vygenerovaným modelem se dokázali zorientovat ve svých datech. Kromě urychlení základního výzkumu proteinových struktur může umělá inteligence pomoci s predikováním vhodných cílů pro léčiva a odhalováním proteinů na povrchu různých patogenů (včetně původců COVID-19, leishmanióz, spavé nemoci, či malárie), hovoří se také o možném využití např. v kosmetickém průmyslu či tvorbě syntetických proteinů k likvidaci odpadů nebo zvyšování nutriční hodnoty zemědělských plodin. Současné nedostatky tohoto přístupu (viz níže) však znamenají, že v dohledné době rozhodně nedojde k opuštění tradičních experimentálních přístupů určování proteinové struktury – rentgenové krystalografie, nukleární magnetické rezonance či kryo-elektronové mikroskopie – je však téměř jisté, že použití umělé inteligence umožní rychlejší, levnější a snazší získávání strukturních dat. 28. července 2022 bylo zveřejněno přes 200 milionů proteinových struktur vyřešených AlphaFoldem ze zhruba milionu druhů, ze kterých jsou dostupné sekvence proteinů. Toto množství struktur představuje většinu známých proteinů.
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ألفافولد (بالإنجليزية: AlphaFold) هو برنامج ذكاء اصطناعي مطور من شركة ديب مايند بهدف توقّع بنية البروتينات؛ وهو مصمم على هيئة نظام قادر على إنجاز التعلّم المتعمّق. نشرت النسخة الأولى من هذا البرنامج سنة 2018، وحل في المرتبة الأولى ضمن برامج التقدير التوقعي لبنية البروتين (CASP)؛ أما النسخة الثانية منه فنشرت أواخر سنة 2020. كانت نتائج النسخة الثانية من البرنامج ذات وقع في المجتمع العلمي؛ وهي متاحة مع برمجيات حرة المصدر للبحث ضمن قواعد بيانات عن المجموع البروتيني (بروتيوم) للأنواع والكائنات الحية.
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AlphaFold ist ein Programm, das Deep Learning nutzt, um eine Proteinstruktur basierend auf der Aminosäuresequenz des Proteins vorherzusagen. Das Programm wurde vom in London ansässigen Unternehmen Deepmind entwickelt und erreichte beim Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction (CASP) Wettbewerb 2018 und 2020 Bestwerte.In der medizinischen Fachwelt wurde dies als Durchbruch der Proteinstrukturvorhersage aufgenommen.Seit dem 15. Juli 2021 unterliegt die Software einer Open-Source-Lizenz – auch für kommerzielle Unternehmen. Zudem wurde die Funktionsweise im Fachjournal Nature veröffentlicht.Jeder kann jetzt Proteine falten oder in Datenbanken (wie der AlphaFold Protein Structure Database) mit automatisch generierten Modellen nachschauen.
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AlphaFold is an artificial intelligence (AI) program developed by DeepMind, a subsidiary of Alphabet, which performs predictions of protein structure. The program is designed as a deep learning system. AlphaFold AI software has had two major versions. A team of researchers that used AlphaFold 1 (2018) placed first in the overall rankings of the 13th Critical Assessment of protein Structure Prediction (CASP) in December 2018. The program was particularly successful at predicting the most accurate structure for targets rated as the most difficult by the competition organisers, where no existing template structures were available from proteins with a partially similar sequence. A team that used AlphaFold 2 (2020) repeated the placement in the CASP competition in November 2020. The team achieved a level of accuracy much higher than any other group. It scored above 90 for around two-thirds of the proteins in CASP's global distance test (GDT), a test that measures the degree to which a computational program predicted structure is similar to the lab experiment determined structure, with 100 being a complete match, within the distance cutoff used for calculating GDT. AlphaFold 2's results at CASP were described as "astounding" and "transformational." Some researchers noted that the accuracy is not high enough for a third of its predictions, and that it does not reveal the mechanism or rules of protein folding for the protein folding problem to be considered solved. Nevertheless, there has been widespread respect for the technical achievement. On 15 July 2021 the AlphaFold 2 paper was published at Nature as an advance access publication alongside open source software and a searchable database of species proteomes.
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AlphaFold es un programa de inteligencia artificial (IA) desarrollado por DeepMind de Alphabets/Google que realiza predicciones de la estructura de las proteínas mediante el sistema de aprendizaje profundo.La primera versión de AlphaFold, conocida como AlphaFold 1, obtuvo el primer lugar en la clasificación general de la 13.ª edición de la competición CASP (Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction, 'evaluación crítica de técnicas para la predicción de la estructura de proteínas') en diciembre de 2018. El programa se destacó particularmente en las predicciones de estructuras para las que no existían modelos previos, consideradas por los organizadores de la competición como las más difíciles. AlphaFold 2, versión desarrollada en 2020, volvió a ganar la competición CASP en noviembre de 2020, con predicciones mucho más exactas que las de cualquier otro programa. En alrededor de dos tercios de las proteínas, AlphaFold 2 obtuvo una puntuación superior a 90 en la prueba de distancia global (GDT), que compara las predicciones de los programas con las estructuras determinadas experimentalmente; una puntuación de 100 denota una coincidencia completa. Los resultados de AlphaFold 2 en CASP han sido calificados como «asombrosos» y «transformadores». Aunque la exactitud de las predicciones no es lo suficientemente alta en un tercio de los casos y el programa no revela ninguna información sobre el mecanismo del plegamiento de las proteínas, el logro técnico ha recibido un reconocimiento generalizado. El 15 de julio de 2021, Nature publicó un artículo sobre AlphaFold2 junto con software de código abierto y una base de datos de búsqueda de proteomas de varias especies.
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AlphaFold est un logiciel d'intelligence artificielle développé par DeepMind, appartenant à Google, qui cherche à prédire la structure des protéines à partir de leur séquence en acides aminés. Le programme est conçu comme un système d'apprentissage profond.
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AlphaFold è un programma di intelligenza artificiale sviluppato da DeepMind (Alphabet/Google) per predire la struttura tridimensionale delle proteine.Il programma è stato progettato come un sistema di deep learning. il software di AlphaFold è stato rilasciato in due versioni. La prima nel 2018 AlphaFold 1 col quale un'equipe di ricercatori si è posizionata al primo posto del 13° (Valutazione critica di tecniche per la predizione della struttura delle proteine). Con la versione AlphaFold 2 del 2020 si posiziona nuovamente al 1º posto nel torneo CASP.. L'equipe ha raggiunto un livello di accuratezza distaccando nettamente tutti gli altri Ha raggiunto un ponteggio superiore a 90 per circa i 2/3 delle proteine del di CASP, un test che misura il grado di un programma computazionale di predire una struttura proteica- comparata ad una struttura determinata in un esperimento di laboratorio, con valore 100 come riscontro perfetto. Il 22 luglio 2021 viene pubblicato la base dati con uno sforzo congiunto tra alphafold e (Istituto europeo di bioinformatica) che contiene quasi tutte le strutture proteiche predette (365.000 ca.) del proteoma umano UniProt e di 20 organismi modello Il 28 luglio 2022 vengono pubblicate le strutture di oltre 200 milioni di proteine. Sempre nel 2022, il software rivale Meta AI ha predetto la struttura di 600 milioni di proteine.
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AlphaFold(アルファフォールド)は、タンパク質の構造予測を実行するGoogleのDeepMindによって開発された人工知能プログラムである。このプログラムは、タンパク質の折り畳み構造を原子の幅に合わせて予測する深層学習システムとして設計されている。 AIソフトウェア「AlphaFold」は、2つの主要バージョンで注目されている。研究者チームはAlphaFold 1 (2018年) を使用して、2018年12月に開催された「第13回 タンパク質構造予測精密評価 (CASP)」の総合ランキングで1位を獲得した。このプログラムは、部分的に類似した配列を持つタンパク質から既存のが利用できない、競技会主催者によって最も難しいと評価されたターゲットの最も正確な構造を予測することに特に成功した。チームは、AlphaFold 2 (2020年) を使用して、2020年11月のCASPコンテストに参加した。チームは、他のどのグループよりもはるかに高い精度を達成した。このプログラムは、CASPのグローバル距離テスト (GDT) において、約3分の2のタンパク質について90以上のスコアを獲得した。これは計算プログラムが予測した構造がラボ実験で決定された構造と類似している度合いを測定するテストで、GDTの計算に使用される距離のカットオフの範囲内で100が完全な一致である。 CASPでのAlphaFold 2の結果は「驚異的」であり、変革的なものであると評された。一部の研究者は、AlphaFoldチームが独立した検証と再実装のためにこの手法を公開していないことを批判し、その成功の理由を理解する必要があると指摘している。それにもかかわらず、この技術的な成果は広く敬意が払われてきた。 2021年6月18日現在、DeepMindのCEOデミス・ハサビスは、AlphaFold 2を説明するために、完全な手法を説明した論文が書き上げられ、公開前のピア・レビューが行われていると発表した。論文にはオープンソースのコードが付属し、「科学コミュニティのためのAlphaFoldへの幅広いフリーアクセス」ができるようになる予定である。
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AlphaFold é um programa de inteligência artificial desenvolvido pela DeepMind do Google que realiza . O programa é projetado como um sistema de aprendizagem profunda. O software AlphaFold AI se destacou em duas versões principais. Uma equipe de pesquisadores que usou o AlphaFold 1 (2018) ficou em primeiro lugar na classificação geral da 13ª (CASP em inglês) em dezembro de 2018. O programa foi particularmente bem-sucedido em prever a estrutura mais precisa para alvos classificados como os mais difíceis pelos organizadores da competição, onde nenhuma estrutura de modelo existente estava disponível a partir de proteínas com uma sequência parcialmente semelhante. Uma equipe que usou o AlphaFold 2 (2020) repetiu a colocação na competição CASP em novembro de 2020. A equipe atingiu um nível de precisão muito maior do que qualquer outro grupo. Ela pontuou acima de 90 para cerca de dois terços das proteínas no teste de distância global CASP (global distance test ou GDT em inglês), um teste que mede o grau em que a estrutura prevista por um programa computacional é semelhante à estrutura determinada no experimento de laboratório, com 100 sendo uma correspondência completa, dentro do corte de distância usado para calcular o GDT. Os resultados do AlphaFold 2 no CASP foram descritos como "surpreendentes" e transformacionais. Alguns pesquisadores notaram que a precisão não é alta o bastante para um terço de suas previsões e que o programa não revela o mecanismo ou as regras do dobramento de proteínas para que o seja considerado resolvido. No entanto, tem havido um respeito generalizado pela conquista técnica. Desde 5 de março de 2021, a DeepMind não disponibilizou nenhum código para o AlphaFold 2 publicamente. Quatro meses depois de anunciar os resultados do CASP14, o site da empresa afirma: "Estamos bem no início de explorar a melhor forma de permitir que outros grupos usem nossas previsões de estrutura, ao lado de preparar um artigo revisado por pares para publicação."
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AlphaFold — программа на базе искусственного интеллекта (AI), разработанная Google DeepMind, которая выполняет предсказания пространственной структуры белка. Программа разработана как система глубокого обучения. AlphaFold имеет две основные версии. Команда исследователей, использовавшая AlphaFold 1, заняла первое место в общем рейтинге 13-й СASP в декабре 2018 года. Программа оказалась особенно успешной в предсказании точных структур белков в категории, которую организаторы конкурса оценивали как самую сложную — когда для белков с частично похожей последовательностью не было доступно существующих шаблонных структур. Команда разработчиков AlphaFold 2 участвовала в следующем конкурсе CASP в ноябре 2020 года. Команда достигла гораздо большей точности, чем любая другая группа. Модель набрала более 90 баллов примерно для двух третей белков в тесте GDT, который измеряет степень, с которой структура, предсказанная вычислительной программой, подобна структуре, определённой лабораторным экспериментом (число 100 соответствует полному совпадению). Результаты AlphaFold 2 в CASP были охарактеризованы как «поразительные». В то же время некоторые исследователи отметили, что точность недостаточно высока для оставшейся трети прогнозов и что не раскрывается механизм и правила сворачивания белка, чтобы проблема сворачивания белка считалась решённой. 15 июля 2021 года статья об AlphaFold2 была размещена в Nature в качестве публикации для предварительного доступа вместе с программным обеспечением с открытым исходным кодом и доступной для поиска базой данных с различными видами белков.
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AlphaFold(直譯:阿爾法折疊)是Alphabet旗下Google旗下DeepMind开发的一款蛋白質結構預測程式。。該程序被設計為一個深度學習系統。 AlphaFold人工智能有2個主要版本:(2018)和(2020)。前者使用AlphaFold 1在2018年12月的第13屆CASP(英語:Critical Assessment of protein Structure Prediction,直譯:蛋白質結構預測的關鍵評估)的排名中第一。該程序特別成功地預測了被競賽組織者評為最困難的目標的最準確結構,其中沒有來自具有部分相似序列的蛋白質的現有模板結構。 蛋白质卷曲折叠會构成三维结构,蛋白质的功能正由其結構決定。了解蛋白質結構有助於開發治療疾病的藥物。DeepMind稱,AlphaFold能在数天内识别蛋白质的形状,而此前學界識別蛋白质形状經常需花費數年時間。2020年11月,在第14届CASP(英語:Critical Assessment of protein Structure Prediction,直譯:蛋白質結構預測的關鍵評估)競賽中,AlphaFold 2(2020)表現良好,中位分数为92.4(满分100分)。它的准确度远远高于其他任何程序 。 2021年7月15日,AlphaFold2 論文在《》雜誌上作為高級訪問出版物與開源軟件和可搜索的物種蛋白質組數據庫一起發表。
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AlphaFold Protein Structure Database